196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2348 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2348  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 309 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2228  glycosyl transferase family protein  99.64 
 
 		 280 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2332  glycosyl transferase family protein  95.36 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5651  glycosyl transferase family protein  95.04 
 
 		 315 aa  564  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1697  glycosyl transferase family protein  95.36 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2309  glycosyl transferase family protein  95.36 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2201  putative signal peptide protein  70.04 
 
 		 286 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0966  glycosyl transferase family protein  52.01 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2203  hypothetical protein  49.64 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 		 785 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 1162 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 		 1077 aa  72.4  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.81 
 
 		 2401 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 		 1739 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  22.13 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  24.03 
 
 		 1523 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  22.81 
 
 		 1523 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 415 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  25.34 
 
 		 860 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.35 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  22.18 
 
 		 1340 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 1268 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.46 
 
 		 610 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.2 
 
 		 427 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  22.4 
 
 		 1119 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  23.24 
 
 		 430 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 683 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0397  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 286 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4364  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  21.64 
 
 		 703 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  27.22 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 337 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 		 832 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  22.39 
 
 		 419 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  30.56 
 
 		 392 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  35.48 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.67 
 
 		 1644 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.67 
 
 		 1644 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 727 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3221  glycosyl transferase family protein  23.27 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0419  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3292  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  22.89 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  24.82 
 
 		 841 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 273 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 334 aa  49.3  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  25.36 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 		 635 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  24.07 
 
 		 700 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 		 994 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 		 988 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.69 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.69 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  21.07 
 
 		 1106 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 		 586 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.36 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  21.27 
 
 		 742 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  22.8 
 
 		 525 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  21.64 
 
 		 742 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  24.14 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 		 729 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  23.6 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.36 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  25.36 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.59 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 		 499 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 		 617 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.59 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  25.36 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 891 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 		 872 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  29.09 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 812 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>