100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1333 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  100 
 
 
275 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  99.64 
 
 
275 aa  553  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  88.41 
 
 
276 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  88.41 
 
 
276 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  88.04 
 
 
276 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  86.96 
 
 
276 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  84.73 
 
 
276 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  64.4 
 
 
323 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  64.22 
 
 
327 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  64.22 
 
 
327 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  64.22 
 
 
327 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  64.22 
 
 
327 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  63.91 
 
 
327 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  68.79 
 
 
280 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  68.32 
 
 
304 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  67.15 
 
 
268 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  67.88 
 
 
268 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  52.71 
 
 
262 aa  254  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  50.36 
 
 
261 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.82 
 
 
331 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  42.45 
 
 
255 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  44.44 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  41.3 
 
 
279 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  43.38 
 
 
282 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  43.79 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  43.68 
 
 
247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  40.15 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  40.15 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  43.3 
 
 
247 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  39.42 
 
 
277 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  41.84 
 
 
266 aa  165  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  43.41 
 
 
251 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  40.57 
 
 
255 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  40.07 
 
 
255 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.31 
 
 
245 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  38.41 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  35.36 
 
 
252 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  35.99 
 
 
268 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  39.71 
 
 
242 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  35.76 
 
 
263 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  34.46 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  34.84 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  36.09 
 
 
292 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  35.69 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  32.19 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  35.91 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  37.5 
 
 
254 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  39.16 
 
 
424 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  31.27 
 
 
265 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  36.71 
 
 
424 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  38.63 
 
 
254 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  31.27 
 
 
264 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  36.65 
 
 
257 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  36.59 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  37.45 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  34.21 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  34.32 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  35.59 
 
 
283 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  34.75 
 
 
259 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  29.14 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  34.83 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  34.4 
 
 
281 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  34.4 
 
 
281 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  32.98 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  35.09 
 
 
276 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  36.62 
 
 
294 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  33.45 
 
 
281 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  27.85 
 
 
284 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  33.45 
 
 
265 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  30.1 
 
 
263 aa  99.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.96 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.86 
 
 
262 aa  95.9  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.84 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
262 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  31.61 
 
 
329 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  34.38 
 
 
174 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  35.23 
 
 
605 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  32.75 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  34.51 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  32.62 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  31.84 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  31.8 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  30.69 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  31.29 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  24.46 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  30.66 
 
 
339 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  29.88 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  37.14 
 
 
158 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  37.14 
 
 
158 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10093  Ser/Thr protein phosphatase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_1G14840)  26.26 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2590  metallophosphoesterase  29.1 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  36 
 
 
174 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  32.75 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5707  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
338 aa  52  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3062  metallophosphoesterase  45.31 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27593  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2865  metallophosphoesterase  30.69 
 
 
235 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0711307  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0332  metallophosphoesterase  34.44 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>