19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6643 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  100 
 
 		 273 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  42.2 
 
 		 244 aa  158  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  37.91 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  37.91 
 
 		 236 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.610599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3246  putative fimbrial protein  36.23 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  33.02 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  33.02 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  32.55 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3389  putative CFA/I fimbrial subunit A  33.33 
 
 		 238 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  32.82 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  24.43 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  28.18 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4568  hypothetical protein  24.26 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0253  hypothetical protein  24.34 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3965  hypothetical protein  24.34 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3658  hypothetical protein  25 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  31.39 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  25.93 
 
 		 228 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  26.19 
 
 		 222 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>