More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1747 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1747  lipoyl synthase  100 
 
 		 321 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412992  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1774  lipoyl synthase  98.13 
 
 		 321 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1860  lipoyl synthase  95.33 
 
 		 321 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328301  normal  0.0230564 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6243  lipoyl synthase  95.33 
 
 		 321 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.875119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1836  lipoyl synthase  95.33 
 
 		 321 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5137  lipoyl synthase  95.31 
 
 		 321 aa  557  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111004  normal  0.561383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1437  lipoyl synthase  93.4 
 
 		 321 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5917  lipoyl synthase  75.47 
 
 		 328 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  76.85 
 
 		 326 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0316  lipoyl synthase  78.26 
 
 		 329 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.880646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  62.26 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  60.61 
 
 		 331 aa  381  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  60.27 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  62.58 
 
 		 320 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  60.27 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  59.26 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  59.26 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  59.26 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  59.93 
 
 		 324 aa  374  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  58.6 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  59.26 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  59.26 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  59.8 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  59.6 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  61.28 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  59.93 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  60.94 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  60.94 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  59.26 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  59.26 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  59.26 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  60.2 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  60.94 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  59.26 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  58.92 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  58.7 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  59.26 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  60.54 
 
 		 315 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  58.92 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  58.92 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  59.93 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  59.26 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  60.07 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  61.28 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  57.57 
 
 		 334 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  58.75 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  59.28 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  59.28 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  58.7 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  61.15 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  59.32 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  58.59 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  61.95 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  61.95 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  59.6 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  58.75 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  58.7 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  60.07 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  57.91 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  60.27 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 321 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 321 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 321 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 321 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  61.87 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  58.92 
 
 		 319 aa  364  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  60.34 
 
 		 332 aa  364  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  59.26 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  58.02 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  58.02 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 321 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  60.82 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  57.91 
 
 		 330 aa  363  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  59.4 
 
 		 321 aa  364  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  59.4 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  59.22 
 
 		 327 aa  363  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  57.91 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  57.91 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  57.58 
 
 		 331 aa  362  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  57.34 
 
 		 327 aa  362  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  57.58 
 
 		 333 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  59.06 
 
 		 321 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1961  lipoyl synthase  54.57 
 
 		 336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  59.32 
 
 		 336 aa  361  8e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  59.06 
 
 		 321 aa  361  8e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  59.06 
 
 		 321 aa  360  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  58.22 
 
 		 321 aa  360  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  59.06 
 
 		 321 aa  360  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  59.06 
 
 		 321 aa  360  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  58.88 
 
 		 321 aa  360  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1161  lipoyl synthase  58.55 
 
 		 321 aa  360  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  59.06 
 
 		 321 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  58.72 
 
 		 321 aa  359  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>