40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2638 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2638  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2773  hypothetical protein  99.66 
 
 
296 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1841  hypothetical protein  90.48 
 
 
344 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0232148  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1746  hypothetical protein  99.64 
 
 
277 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3064  hypothetical protein  99.64 
 
 
277 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2256  hypothetical protein  99.64 
 
 
277 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2694  hypothetical protein  99.64 
 
 
277 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1527  hypothetical protein  99.64 
 
 
277 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5461  hypothetical protein  78.98 
 
 
298 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1119  hypothetical protein  83.02 
 
 
275 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679333  normal  0.691739 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2170  hypothetical protein  80.81 
 
 
275 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5925  hypothetical protein  80.81 
 
 
275 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2152  hypothetical protein  80.81 
 
 
275 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2062  hypothetical protein  82.89 
 
 
275 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2189  hypothetical protein  81.92 
 
 
275 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1484  hypothetical protein  69.2 
 
 
289 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1518  hypothetical protein  66.54 
 
 
277 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507062  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2618  hypothetical protein  66.54 
 
 
277 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0275442  normal  0.821137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1255  hypothetical protein  53.58 
 
 
285 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2065  hypothetical protein  53.88 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1083  putative transmembrane protein  52.92 
 
 
285 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.677666  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1175  hypothetical protein  52.92 
 
 
285 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2061  transmembrane protein  55.6 
 
 
291 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0694  putative transmembrane protein  43.12 
 
 
289 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.815168 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1257  putative transmembrane protein  42.03 
 
 
289 aa  232  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.243356  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2078  hypothetical protein  43.01 
 
 
291 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1805  putative transmembrane protein  43.84 
 
 
308 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000250294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2782  putative transmembrane protein  43.51 
 
 
302 aa  186  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3579  hypothetical protein  39.69 
 
 
298 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1107  putative transmembrane protein  40.53 
 
 
300 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1187  putative transmembrane protein  40.53 
 
 
300 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2977  putative transmembrane protein  42.48 
 
 
298 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3156  putative transmembrane protein  42.54 
 
 
271 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1630  putative transmembrane protein  42.12 
 
 
294 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1440  putative transmembrane protein  36.5 
 
 
297 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5004  putative transmembrane protein  39.69 
 
 
295 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.786867  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1179  protein of unknown function DUF540  32.14 
 
 
258 aa  95.9  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  31.82 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  32.4 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1878  transmembrane protein  25.5 
 
 
261 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>