More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1930 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1930  transposase  100 
 
 
297 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5094  integrase catalytic region  98.2 
 
 
278 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5564  integrase catalytic region  98.2 
 
 
278 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923042  normal  0.135572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5055  integrase catalytic region  98.2 
 
 
278 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6833  integrase catalytic subunit  98.2 
 
 
278 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4856  integrase catalytic subunit  97.53 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3310  integrase catalytic subunit  97.53 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1993  integrase catalytic subunit  80.94 
 
 
278 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.140355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2556  integrase catalytic subunit  80.94 
 
 
278 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2605  Integrase catalytic region  84.65 
 
 
273 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.238238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2331  ISRSO10-transposase ORFB protein  71.92 
 
 
295 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4251  integrase catalytic region  69.49 
 
 
300 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1830  ISRSO10-transposase ORFB protein  72.14 
 
 
282 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.189696  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0096  transposase  67.47 
 
 
295 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0366  transposase  67.47 
 
 
295 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1453  transposase  67.47 
 
 
295 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1536  transposase  67.47 
 
 
295 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  67.47 
 
 
295 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2744  transposase  67.47 
 
 
295 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936564  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1792  integrase catalytic region  70.8 
 
 
281 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.540172 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0567  ISRSO10-transposase ORFB protein  70.61 
 
 
282 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  58.97 
 
 
301 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  58.97 
 
 
301 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  58.97 
 
 
301 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  58.97 
 
 
301 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  58.97 
 
 
301 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  58.97 
 
 
301 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  60 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0290  IS2 transposase orfB  60 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  59.65 
 
 
301 aa  335  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0704  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  335  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  58.56 
 
 
303 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  58.56 
 
 
303 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  59.65 
 
 
301 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  59.3 
 
 
301 aa  332  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  59.3 
 
 
301 aa  332  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1435  ISRSO10-transposase ORFB protein  74.24 
 
 
200 aa  291  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927886  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0460  ISRSO10-transposase ORFB protein  74.24 
 
 
200 aa  291  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112224  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0717  transposase  85.81 
 
 
235 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01904  IS2 insertion element transposase InsAB'  65.35 
 
 
218 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2065  Integrase catalytic region  65.35 
 
 
218 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0456907  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6582  transposase  61.19 
 
 
224 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191311  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2024  integrase catalytic subunit  49.64 
 
 
282 aa  261  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2405  integrase catalytic subunit  50 
 
 
281 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0055  integrase catalytic subunit  49.28 
 
 
282 aa  259  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000315593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0168  integrase catalytic subunit  49.28 
 
 
282 aa  259  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2174  integrase catalytic subunit  49.28 
 
 
282 aa  259  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6414  integrase catalytic region  51.11 
 
 
273 aa  258  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3631  IS2 transposase orfB  64.92 
 
 
206 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4141  hypothetical protein  50.18 
 
 
277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4393  integrase catalytic subunit  50.18 
 
 
277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0086  IS2, transposase orfB, truncation  63.54 
 
 
223 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0106176  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0740  integrase catalytic subunit  50 
 
 
277 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4643  integrase catalytic region  48.35 
 
 
275 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3181  integrase catalytic subunit  51.11 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4356  transposase InsD for insertion element IS2A/D/F/H/I/K  57.3 
 
 
183 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6515  hypothetical protein  47.66 
 
 
351 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0568004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0305  IS2 ORF2  63.64 
 
 
121 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.726733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>