39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0248 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  100 
 
 		 150 aa  316  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  99.33 
 
 		 150 aa  315  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  90.67 
 
 		 150 aa  295  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  89.33 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  76.67 
 
 		 150 aa  254  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  80.67 
 
 		 150 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  72 
 
 		 173 aa  241  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  67.33 
 
 		 150 aa  222  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  64.67 
 
 		 150 aa  221  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  62 
 
 		 150 aa  209  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  62.67 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  62.67 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  62 
 
 		 150 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  57.33 
 
 		 150 aa  200  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  56.67 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  52.67 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  52 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  52 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  53.33 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  52.05 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  49.33 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  52.67 
 
 		 141 aa  146  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  50 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  46.36 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  41.1 
 
 		 277 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  37.67 
 
 		 272 aa  97.1  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  39.84 
 
 		 290 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  39.84 
 
 		 290 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  34.01 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 253 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 238 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  33.93 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  32.04 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  22.22 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 311 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  26.32 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  32.18 
 
 		 334 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  30.53 
 
 		 291 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5829  putative cytochrome c protein, class I  26.19 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>