More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0953 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0953  amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
240 aa  474  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2236  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  92.08 
 
 
240 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1563  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  70.46 
 
 
237 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086799  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1589  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.8 
 
 
267 aa  301  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2290  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.09 
 
 
268 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142141  normal  0.98078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.09 
 
 
268 aa  295  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28022  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2065  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  65.52 
 
 
267 aa  290  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2322  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.44 
 
 
239 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893058  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3594  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  50.44 
 
 
239 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2178  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.44 
 
 
239 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142027  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2809  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.56 
 
 
239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309944  normal  0.926456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.22 
 
 
229 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0597  amino acid ABC transporter, permease protein  44.35 
 
 
240 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0884053  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4835  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
240 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.137601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.17 
 
 
246 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  41.15 
 
 
244 aa  169  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5921  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.57 
 
 
241 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610786  normal  0.165756 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  40.87 
 
 
244 aa  169  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.13 
 
 
241 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1828  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
240 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300709  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.63 
 
 
230 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5359  amino acid ABC transporter, permease protein  45.87 
 
 
231 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4271  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.18 
 
 
231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000112521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5892  ABC transporter permease  42.6 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68080  ABC transporter permease  42.41 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  0.0204508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3519  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.15 
 
 
240 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405389  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5101  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.43 
 
 
240 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381438  decreased coverage  0.00220155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4285  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.3 
 
 
225 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0276895  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4913  amino acid ABC transporter permease  44.04 
 
 
231 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4840  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 
225 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  0.251621 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7394  ABC transporter membrane spanning protein  37.91 
 
 
240 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0310  amino acid ABC transporter permease  42.6 
 
 
231 aa  158  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193986  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1654  arginine transporter permease subunit ArtQ  40.93 
 
 
246 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.571683 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6801  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.3 
 
 
225 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793236  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2782  amino acid ABC transporter permease  42.22 
 
 
238 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2880  arginine/ornithine transport system permease protein  41.88 
 
 
229 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0976589  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4929  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 
231 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205937  hitchhiker  0.0000000789331 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7240  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  38.99 
 
 
256 aa  154  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0593694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.62 
 
 
232 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1524  amino acid ABC transporter permease  38.53 
 
 
229 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26230  histidine transport system permease protein  38.67 
 
 
229 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0832582  normal  0.643473 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5750  amino acid ABC transporter permease  38.81 
 
 
240 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5839  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
240 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.81 
 
 
240 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4137  amino acid ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5068  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.59 
 
 
240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.458442  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1593  arginine transport system permease protein  40 
 
 
221 aa  152  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5622  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 
240 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129998  normal  0.660092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3875  amino acid ABC transporter permease  37.07 
 
 
242 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.61 
 
 
229 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.3 
 
 
230 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016104  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0592  arginine ABC transporter, permease protein  40 
 
 
221 aa  152  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0258675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0299  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.3 
 
 
230 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0837568  normal  0.0626241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2377  ABC His/Glu/Gln/Arg/opine transporter, inner membrane subunit  36.12 
 
 
243 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413222  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0253  arginine transporter permease subunit ArtQ  41.46 
 
 
223 aa  152  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00505088  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0281  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  43.3 
 
 
230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0627068  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6596  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.81 
 
 
240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20911 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2686  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.99 
 
 
228 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1022  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.33 
 
 
238 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.563398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00867  arginine transporter subunit  37.33 
 
 
238 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.202852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2780  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.33 
 
 
238 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1581  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.72 
 
 
238 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00873  hypothetical protein  37.33 
 
 
238 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.202246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0935  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.33 
 
 
238 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2712  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.72 
 
 
238 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0890  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.33 
 
 
238 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  37.86 
 
 
229 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4291  amino acid ABC transporter permease  38.35 
 
 
229 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 
229 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2734  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.33 
 
 
238 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586836  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4638  amino acid ABC transporter permease  36.56 
 
 
229 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.56 
 
 
229 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2627  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.72 
 
 
238 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0966  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.33 
 
 
238 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 
229 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01551  ABC transporter permease protein  36.6 
 
 
246 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2469  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.33 
 
 
238 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.391563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02233  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  36.53 
 
 
228 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1348  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.53 
 
 
228 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003971  arginine/ornithine ABC transporter permease protein AotQ  36.17 
 
 
246 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4485  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  38.16 
 
 
229 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 
229 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0905208  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02193  hypothetical protein  36.53 
 
 
228 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.53 
 
 
228 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.917469  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2464  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.53 
 
 
228 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2602  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.53 
 
 
228 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.311053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2458  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.53 
 
 
228 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2703  histidine ABC transporter permease HisQ  36.24 
 
 
228 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3796  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.12 
 
 
229 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.719623  normal  0.0561262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2594  histidine ABC transporter permease HisQ  36.24 
 
 
228 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3448  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.53 
 
 
228 aa  148  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2540  histidine ABC transporter permease protein HisQ  36.24 
 
 
228 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.512507  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2582  histidine ABC transporter permease HisQ  36.24 
 
 
228 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.58 
 
 
229 aa  148  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
229 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2494  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.24 
 
 
228 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174518  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05530  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.67 
 
 
229 aa  148  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001574  arginine ABC transporter permease protein ArtQ  37.21 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.552599  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1410  histidine ABC transporter, permease protein  36.12 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157931  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1378  arginine transporter permease subunit ArtQ  36 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>