More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0887 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0878  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  99.5 
 
 
222 aa  410  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0671746  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0887  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2340  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  90.45 
 
 
222 aa  358  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1801  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.75 
 
 
216 aa  203  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111144  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0520  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2663  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.581006  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1492  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42 
 
 
217 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.829332  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1690  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42 
 
 
217 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1169  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  40 
 
 
217 aa  154  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4410  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  37.5 
 
 
215 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3032  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  35.5 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1903  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  36.5 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.486283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2521  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  36.32 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0652814  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1792  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.36 
 
 
215 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.0332826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2782  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  36.82 
 
 
217 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2544  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1204  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1978  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.145869  normal  0.127834 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0927  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  37.76 
 
 
218 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4414  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  37 
 
 
219 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2737  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  38.31 
 
 
217 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45151  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3179  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  36.32 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3113  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  35.53 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2137  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.98 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.201933  normal  0.500345 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2730  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.85 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0060  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  36.46 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  35.38 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.36 
 
 
208 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3350  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.36 
 
 
208 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1058  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  36.32 
 
 
211 aa  115  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3344  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  36.41 
 
 
211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110739  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.36 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3295  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.85 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.85 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1433  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  37.31 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0886457  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.85 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0283834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1768  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  33.5 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.597766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1191  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.74 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3116  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.82 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1794  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.34 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3236  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.82 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3132  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.82 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.146098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.82 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.51 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.28 
 
 
666 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3273  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  35.26 
 
 
211 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1616  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  35.45 
 
 
219 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0577413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2419  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.85 
 
 
219 aa  108  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2355  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.86 
 
 
220 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1067  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.99 
 
 
222 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.929448  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1773  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0590351  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.74 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.31 
 
 
208 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.701477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.74 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1243  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.74 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.485227  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002514  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.16 
 
 
208 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.54 
 
 
225 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2831  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.21 
 
 
232 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0870  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.33 
 
 
208 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1202  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.68 
 
 
211 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00210603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1122  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.74 
 
 
211 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1922  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.83 
 
 
220 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1042  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  34.03 
 
 
211 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02593  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.79 
 
 
208 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0945  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.79 
 
 
208 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134508  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2508  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.33 
 
 
208 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3044  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.79 
 
 
208 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2881  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.79 
 
 
208 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.79 
 
 
208 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02558  hypothetical protein  31.79 
 
 
208 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2868  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.79 
 
 
208 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.21 
 
 
211 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.968624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1192  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.21 
 
 
211 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0906  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  35.45 
 
 
665 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266442  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3131  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.79 
 
 
208 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0969  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.79 
 
 
208 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.533941  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0015  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.62 
 
 
215 aa  105  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3214  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.31 
 
 
208 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1846  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.85 
 
 
322 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197153  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1356  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.85 
 
 
322 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.85 
 
 
322 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576463  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.98 
 
 
660 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  35.45 
 
 
217 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1118  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.85 
 
 
331 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3811  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  35.79 
 
 
218 aa  104  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0318  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.57 
 
 
215 aa  104  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.975543 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.86 
 
 
657 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1430  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  35.05 
 
 
220 aa  104  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2700  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  36.45 
 
 
230 aa  104  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3434  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.16 
 
 
211 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2367  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.34 
 
 
322 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1342  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  34.8 
 
 
234 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.787511 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2238  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.34 
 
 
322 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.33511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2224  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.34 
 
 
327 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2200  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.34 
 
 
322 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  36.51 
 
 
219 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0474  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.462994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1296  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  34.74 
 
 
211 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136531 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1190  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.95 
 
 
213 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000833235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5883  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.82 
 
 
218 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>