27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0654 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  100 
 
 
387 aa  789    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  59.38 
 
 
370 aa  461  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  45.04 
 
 
372 aa  342  7e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0869  hypothetical protein  34 
 
 
392 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2106  hypothetical protein  31.5 
 
 
379 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0725633 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1615  hypothetical protein  35.09 
 
 
413 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06420  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  29.95 
 
 
407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224562  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  31.93 
 
 
403 aa  159  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  34.44 
 
 
406 aa  153  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.36 
 
 
397 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  29.18 
 
 
401 aa  123  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  27.57 
 
 
375 aa  53.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  24.43 
 
 
337 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  21.59 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  37.93 
 
 
269 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  24.67 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03651  hypothetical protein  40.38 
 
 
203 aa  46.6  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.27 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  27.27 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  23.47 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.39 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  25.27 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  27.01 
 
 
353 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1036  hypothetical protein  50 
 
 
188 aa  43.9  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  24.34 
 
 
344 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  23.57 
 
 
340 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  24.44 
 
 
353 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>