32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0324 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
431 aa  895    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  48.1 
 
 
433 aa  414  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  38.5 
 
 
399 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  35.24 
 
 
408 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  35.61 
 
 
396 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  33.76 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  33.17 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  32.99 
 
 
407 aa  207  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  31.84 
 
 
394 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  32.81 
 
 
383 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  31.04 
 
 
420 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  30.46 
 
 
402 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  29.7 
 
 
444 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  26.75 
 
 
399 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  28.03 
 
 
419 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  29.98 
 
 
401 aa  156  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  29.02 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  21.83 
 
 
407 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  25.97 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  22.04 
 
 
399 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  25.16 
 
 
414 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  23.89 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  25.07 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  23.59 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  21.76 
 
 
358 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  29.21 
 
 
415 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  23.85 
 
 
383 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  26.57 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  23.42 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  26.57 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  25.76 
 
 
403 aa  46.6  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  23.3 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>