More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0216 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0216  aminopeptidase P  100 
 
 
531 aa  1100    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56198  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0463  peptidase, M24 family  75.98 
 
 
531 aa  825    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27810  Xaa-Pro aminopeptidase  52.86 
 
 
522 aa  528  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.517657  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0703  peptidase M24  53.15 
 
 
517 aa  519  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2508  Xaa-Pro aminopeptidase  52.52 
 
 
531 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000105082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2788  Xaa-Pro aminopeptidase  51.43 
 
 
530 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.364809  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11300  Xaa-Pro aminopeptidase  51.1 
 
 
515 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2910  peptidase M24  52.26 
 
 
513 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0334658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2481  peptidase M24  51.95 
 
 
517 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15300  Xaa-Pro aminopeptidase  49.7 
 
 
532 aa  492  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0288526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1161  Xaa-Pro aminopeptidase  49.31 
 
 
531 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398312  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19260  Xaa-Pro aminopeptidase  48.59 
 
 
494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00637043  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0769  peptidase M24  51.61 
 
 
521 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0463  peptidase M24  47.39 
 
 
500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0543  peptidase M24  46.79 
 
 
500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1246  Xaa-Pro aminopeptidase  44.67 
 
 
627 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623221  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3497  Xaa-Pro aminopeptidase  45.73 
 
 
539 aa  411  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.434008  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5913  Xaa-Pro aminopeptidase  43.5 
 
 
479 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.117741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3284  Xaa-Pro aminopeptidase  44.74 
 
 
492 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.331819  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3026  hypothetical protein  42.8 
 
 
485 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371116  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1744  xaa-Pro aminopeptidase  41.25 
 
 
510 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0389057  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3058  Xaa-Pro aminopeptidase  43.83 
 
 
492 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.11104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3048  peptidase M24  42.56 
 
 
501 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.178755  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2427  peptidase M24  43.94 
 
 
496 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4713  Xaa-Pro aminopeptidase  40.95 
 
 
453 aa  362  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1364  Xaa-Pro aminopeptidase  43.09 
 
 
480 aa  359  6e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0669  Xaa-Pro aminopeptidase  39.59 
 
 
506 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.519514  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  32.98 
 
 
461 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  34.76 
 
 
414 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  32.6 
 
 
439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  33.12 
 
 
434 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  33.11 
 
 
443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  33.82 
 
 
441 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2816  peptidase M24  32.97 
 
 
441 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000333195  normal  0.738801 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  33.68 
 
 
441 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  32.02 
 
 
444 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  31.19 
 
 
444 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3287  aminopeptidase P  33.56 
 
 
439 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  33.56 
 
 
436 aa  205  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  33.69 
 
 
441 aa  205  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3406  peptidase M24  33.56 
 
 
439 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  33.76 
 
 
461 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  31.53 
 
 
444 aa  203  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  33.33 
 
 
439 aa  203  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  31.58 
 
 
444 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16321  putative aminopeptidase P  30.93 
 
 
441 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  30.82 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  31.55 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1535  putative aminopeptidase P  30.15 
 
 
441 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.999654  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16441  putative aminopeptidase P  30.57 
 
 
441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.689084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  31.68 
 
 
441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  31.09 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  32.85 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  33.12 
 
 
461 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  32.91 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  33.12 
 
 
461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  33.12 
 
 
461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  31.57 
 
 
443 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  31.29 
 
 
444 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  33.33 
 
 
464 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  32.84 
 
 
461 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  33.55 
 
 
439 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  31.25 
 
 
444 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  32.74 
 
 
446 aa  196  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  32.74 
 
 
446 aa  196  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  31.57 
 
 
465 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  31 
 
 
449 aa  195  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  33.55 
 
 
439 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  31.92 
 
 
439 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15611  putative aminopeptidase P  34.87 
 
 
439 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  31.46 
 
 
474 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  29.68 
 
 
439 aa  193  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  30.88 
 
 
437 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  31.75 
 
 
445 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  32.29 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  31.12 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  30.91 
 
 
444 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  29.77 
 
 
439 aa  190  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  32.81 
 
 
437 aa  190  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  32.91 
 
 
514 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  31.13 
 
 
436 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  31 
 
 
437 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  31.36 
 
 
462 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  30.91 
 
 
444 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  31.13 
 
 
436 aa  189  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2176  aminopeptidase P  33.03 
 
 
426 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  32.16 
 
 
458 aa  188  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  32.31 
 
 
454 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  31.83 
 
 
439 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  31.04 
 
 
459 aa  187  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  30.89 
 
 
440 aa  186  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  29.75 
 
 
442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  32.83 
 
 
442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  31.04 
 
 
454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  32.96 
 
 
436 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  31.38 
 
 
439 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16211  putative aminopeptidase P  29.39 
 
 
441 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.878711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  30.02 
 
 
437 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  30.02 
 
 
437 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  30.02 
 
 
437 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>