299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0594 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0594  tRNA-Phe  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00055  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00056658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00079  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0014  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0086  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4599  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3610  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3358  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3281  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4591  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.441265  normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5068  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0021  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811173  normal  0.0253412 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4281  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0037  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3111  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0206196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0011  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281191 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4603  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000814099  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0071  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.171238  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4682  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0064  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4722  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00159768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0073  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.824805  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0733  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00229797  decreased coverage  0.0082117 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0161  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129088 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0083  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0016  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0448641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0101  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341068  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0091  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.704949  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3366  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557417  normal  0.506535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0080  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4717  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819491  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0079  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3292  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166074 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3461  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368923  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4739  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653879  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4271  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128449  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4210  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4698  tRNA-Phe  95.89 
 
 
78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5108  tRNA-Phe  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4952  tRNA-Phe  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5650  tRNA-Phe  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000510114  normal  0.526212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0016  tRNA-Phe  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0017  tRNA-Phe  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0071  tRNA-Phe  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0026  tRNA-Phe  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.981393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0062  tRNA-Phe  95.16 
 
 
76 bp  99.6  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.205549  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0063  tRNA-Phe  93.55 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0004  tRNA-Phe  93.55 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.111017 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0043  tRNA-Phe  93.55 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0067  tRNA-Phe  93.55 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000000833232  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0024  tRNA-Phe  93.55 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  94.55 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0035  tRNA-Phe  94.55 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0073  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000194446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0002  tRNA-Phe  94.55 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0002  tRNA-Phe  94.55 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0002  tRNA-Phe  94.55 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0052  tRNA-Phe  94.55 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000909923  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0002  tRNA-Phe  94.55 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02500  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0173086 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0038  tRNA-Phe  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0035  tRNA-Phe  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0006  tRNA-Phe  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0038  tRNA-Phe  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000542826  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0034  tRNA-Phe  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000955426  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0113  tRNA-Phe  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465386  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0269  tRNA-Phe  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  92.98 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0068  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPhe01  tRNA-Phe  92.98 
 
 
79 bp  81.8  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  92.98 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0003  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.22263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0006  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0241224  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0017  tRNA-Phe  91.67 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0017  tRNA-Phe  91.67 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0066  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0398911  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0015  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0014  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.58788  hitchhiker  0.00239858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0046  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0059  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0082  tRNA-Phe  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0076  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  hitchhiker  0.00000000192681 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5887  tRNA-Phe  92.73 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60610  tRNA-Phe  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.820326  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0002  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna30  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.319262  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0065  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132855  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68030  tRNA-Phe  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351538  hitchhiker  0.008643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0028  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000645799  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60620  tRNA-Phe  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.787941  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27710  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t081  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0051  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812536  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0053  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850923  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0124  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101919  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0052  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0041266  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5069  tRNA-OTHER  95.65 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>