299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_R0002 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_R0002  tRNA-Phe  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0002  tRNA-Phe  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0002  tRNA-Phe  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0002  tRNA-Phe  97.26 
 
 
73 bp  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0067  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000000833232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0043  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0024  tRNA-Phe  98.21 
 
 
76 bp  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0063  tRNA-Phe  98.21 
 
 
76 bp  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135232  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0017  tRNA-Phe  96.55 
 
 
76 bp  99.6  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0017  tRNA-Phe  96.55 
 
 
76 bp  99.6  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPhe01  tRNA-Phe  96.43 
 
 
79 bp  95.6  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0055  tRNA-Phe  93.75 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108709  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0193  tRNA-Phe  96.36 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0260  tRNA-Phe  96.36 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2156  tRNA-Phe  96.36 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2770  tRNA-Phe  96.36 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0191  tRNA-Phe  96.36 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.285642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0250  tRNA-Phe  96.36 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1867  tRNA-Phe  96.36 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2455  tRNA-Phe  96.36 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0059  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0052  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000909923  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0028  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000645799  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0043  tRNA-Phe  90.41 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0060  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000308543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  90.41 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0010  tRNA-Phe  94.74 
 
 
73 bp  89.7  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0061  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000000629248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00055  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00056658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00079  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0014  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0086  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4698  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4682  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3461  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368923  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t60  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0073  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.824805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0035  tRNA-Phe  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4271  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128449  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4599  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA76  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4281  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0021  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811173  normal  0.0253412 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0053  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000574289  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R9  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0186279  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4717  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819491  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4603  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000814099  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0004  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.111017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4210  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3281  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4591  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.441265  normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3292  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3610  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0011  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0064  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0071  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.171238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0733  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00229797  decreased coverage  0.0082117 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0161  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129088 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5068  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0083  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0037  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0080  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0016  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0448641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0091  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.704949  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3111  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0206196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0101  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341068  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0079  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0062  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.205549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5108  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4722  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00159768  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3366  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557417  normal  0.506535 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4739  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653879  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3358  tRNA-Phe  94.64 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0013  tRNA-Phe  92.06 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0091  tRNA-Phe  92.06 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000501054  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0594  tRNA-Phe  94.55 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0059  tRNA-Phe  92.54 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5701  tRNA-Phe  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000879841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  93.1 
 
 
79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000285644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  93.1 
 
 
79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00368235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  93.1 
 
 
79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000275824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000306908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  93.1 
 
 
79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  93.1 
 
 
79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000662061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0047  tRNA-Phe  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000150278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0076  tRNA-Phe  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  hitchhiker  0.00000000192681 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0161647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  93.1 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0125  tRNA-Phe  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00709498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0002  tRNA-Phe  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5887  tRNA-Phe  93.1 
 
 
78 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0107  tRNA-Phe  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00870398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0080  tRNA-Phe  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000066232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>