89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4959 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4959  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00383302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  35.96 
 
 		 135 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  36.04 
 
 		 168 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7692  insertion element protein  35.42 
 
 		 152 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382154  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  33.33 
 
 		 142 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  54.55 
 
 		 133 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  54.55 
 
 		 133 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 		 125 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 143 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 143 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 143 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 133 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2784  transposase IS3/IS911  33.75 
 
 		 88 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0108  transposase IS3/IS911  33.75 
 
 		 88 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2022  transposase IS3/IS911  33.75 
 
 		 88 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  58.54 
 
 		 135 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  58.54 
 
 		 135 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  58.54 
 
 		 135 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 95 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  38.16 
 
 		 139 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 		 160 aa  45.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 		 156 aa  45.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 		 156 aa  45.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  46.67 
 
 		 122 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  34.62 
 
 		 121 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 133 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 133 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 133 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4780  transposase IS3/IS911 family protein  39.73 
 
 		 128 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  56.1 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  28.93 
 
 		 133 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  56.1 
 
 		 141 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  28.93 
 
 		 133 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  34.62 
 
 		 121 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 133 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 		 133 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  41.07 
 
 		 133 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  34.62 
 
 		 121 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  34.62 
 
 		 121 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  52.63 
 
 		 133 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  34.62 
 
 		 121 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  34.62 
 
 		 121 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 		 122 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 		 122 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 88 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4052  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 88 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0401  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 88 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  45.65 
 
 		 138 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 88 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 88 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 		 122 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 88 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 152 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 152 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 152 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 136 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 152 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 136 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 136 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 136 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 136 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  45.45 
 
 		 136 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  32.5 
 
 		 88 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  32.5 
 
 		 88 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  32.5 
 
 		 88 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  52.27 
 
 		 135 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  40.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 154 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  46.34 
 
 		 129 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>