More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03570 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0449  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  89.89 
 
 
469 aa  859    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5068  adenosylhomocysteinase  86.24 
 
 
469 aa  830    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.724438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0460  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.45 
 
 
469 aa  838    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0968  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.47 
 
 
474 aa  695    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0571313 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0534  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.52 
 
 
465 aa  739    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5280  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.67 
 
 
469 aa  840    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0414  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.55 
 
 
470 aa  725    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0691  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.52 
 
 
468 aa  739    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000631949  unclonable  0.000000000159146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0915  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.28 
 
 
473 aa  700    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0469  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.61 
 
 
467 aa  728    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.410988  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1448  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.9 
 
 
474 aa  695    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.42 
 
 
469 aa  833    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5025  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.61 
 
 
469 aa  835    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03570  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
465 aa  962    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0760213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05620  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  89.68 
 
 
469 aa  863    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3043  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.21 
 
 
464 aa  719    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4849  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.26 
 
 
469 aa  841    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0697439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0532  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  90.11 
 
 
465 aa  866    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.04 
 
 
441 aa  523  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.04 
 
 
441 aa  522  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60 
 
 
437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61 
 
 
430 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.09 
 
 
432 aa  511  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.78 
 
 
435 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.389132  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.3 
 
 
438 aa  498  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.51 
 
 
434 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  56.59 
 
 
438 aa  490  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.79 
 
 
441 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.06 
 
 
438 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  57.92 
 
 
431 aa  478  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  55.44 
 
 
436 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.82 
 
 
438 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.79 
 
 
438 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.94 
 
 
464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.41 
 
 
449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  56.01 
 
 
449 aa  465  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  51.88 
 
 
475 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.48 
 
 
478 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.2 
 
 
472 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.77 
 
 
478 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.03 
 
 
467 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  50.69 
 
 
476 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.87 
 
 
476 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.35 
 
 
477 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.71 
 
 
472 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.55 
 
 
485 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.59 
 
 
478 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  50.99 
 
 
475 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.86 
 
 
435 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.93 
 
 
473 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.24 
 
 
476 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.3 
 
 
475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.14 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.41 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.14 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.14 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.54 
 
 
470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.53 
 
 
472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.35 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.08 
 
 
498 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.14 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.14 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.08 
 
 
481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.4 
 
 
480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.14 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.53 
 
 
472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.34 
 
 
442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.970546  normal  0.403341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.33 
 
 
471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.64 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.23 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.02 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.53 
 
 
472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.55 
 
 
465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.9 
 
 
496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.41 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.14 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.41 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.89 
 
 
471 aa  450  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.13 
 
 
474 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  53.55 
 
 
450 aa  450  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.78 
 
 
485 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.02 
 
 
472 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.14 
 
 
473 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.8 
 
 
496 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.35 
 
 
470 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.71 
 
 
469 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.35 
 
 
465 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.74 
 
 
472 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.21 
 
 
472 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.13 
 
 
474 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  50.88 
 
 
485 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.98 
 
 
485 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.916125 
 
 
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NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.2 
 
 
480 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
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NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.61 
 
 
479 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.93 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007298  Daro_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.71 
 
 
470 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.72 
 
 
476 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.32 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
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NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.3 
 
 
471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
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