216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7600 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5133  peptidase M24  91.14 
 
 		 474 aa  921    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5371  peptidase M24  86.71 
 
 		 474 aa  889    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7600  proline dipeptidase  100 
 
 		 474 aa  988    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  27.74 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0525  peptidase M24  24.09 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  21.2 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  22.61 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  20.81 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  20.52 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  20.52 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  20.75 
 
 		 365 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  20.75 
 
 		 365 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  20.52 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  20.57 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  22.22 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2626  hydrolase/M24 family peptidase  23.63 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000124819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4527  hydrolase/M24 family peptidase  23.63 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000187713  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  20.23 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3901  peptidase M24  25.33 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  20.81 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  23.33 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  21.05 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1771  peptidase M24  27.4 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0652129  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  21.05 
 
 		 356 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  21.05 
 
 		 356 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  21.49 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2880  peptidase M24  24.35 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  19.94 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5287  peptidase M24  24.31 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.912163  normal  0.238252 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  20.91 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  22.86 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  21.05 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  20.91 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  22.29 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  21.16 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4843  peptidase M24  23.89 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1418  putative peptidase  21.84 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1308  putative peptidase  21.84 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.469292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  20.7 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  21.33 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  21.33 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  21.53 
 
 		 356 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  21.88 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  22.36 
 
 		 414 aa  56.6  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  23.17 
 
 		 361 aa  56.6  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  21.02 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0666  peptidase M24  22.53 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  24.68 
 
 		 251 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  20.88 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2124  peptidase M24  26.37 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  24.76 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  21.02 
 
 		 353 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  24.18 
 
 		 403 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  21.41 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  20.7 
 
 		 353 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  28 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  20.7 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  20.07 
 
 		 356 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  23.16 
 
 		 355 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  21.38 
 
 		 432 aa  54.3  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  20.7 
 
 		 353 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  20.7 
 
 		 353 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  20.7 
 
 		 353 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  21.57 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0276  peptidase M24  23.73 
 
 		 467 aa  53.5  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  22.34 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  27.75 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3034  aminopeptidase P  24.14 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  20.57 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  27.15 
 
 		 248 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  22.62 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2242  putative endopeptidase  23.76 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193239  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  26.86 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2132  putative endopeptidase  23.76 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  20.38 
 
 		 353 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  26.86 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  22.93 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  24.37 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  27.27 
 
 		 258 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  23.08 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  23.12 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  22.01 
 
 		 353 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  22.29 
 
 		 348 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  20.38 
 
 		 353 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  23.7 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  26.92 
 
 		 250 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2140  putative endopeptidase  23.76 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332227  normal  0.318783 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1756  methionine aminopeptidase  25.79 
 
 		 252 aa  51.2  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0318499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  26.92 
 
 		 250 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  27.01 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  28.57 
 
 		 248 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  25.12 
 
 		 357 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0461  creatinase  23.29 
 
 		 419 aa  50.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  20.38 
 
 		 353 aa  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  22.55 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  22.67 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  29.25 
 
 		 265 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2491  creatinase  23.77 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2374  peptidase M24  23.83 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.429708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  23.35 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>