More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7230 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7230  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 355 aa  704    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.983063  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6095  ABC transporter related  76.63 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.733778 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6508  ABC transporter related  74.56 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  62.31 
 
 		 352 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  62.31 
 
 		 352 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  62.87 
 
 		 337 aa  394  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1103  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  52.06 
 
 		 344 aa  335  9e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  51.91 
 
 		 369 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  53.8 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  53.8 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  50.95 
 
 		 374 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  53.8 
 
 		 392 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  52.34 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  53.03 
 
 		 369 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  52.99 
 
 		 391 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  52.74 
 
 		 369 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  52.71 
 
 		 391 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  53.37 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  53.75 
 
 		 376 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  53.22 
 
 		 398 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.8 
 
 		 369 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.54 
 
 		 377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  50.86 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.76 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  54.35 
 
 		 388 aa  299  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  52.37 
 
 		 386 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  54.72 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  51.48 
 
 		 386 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  50.91 
 
 		 368 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0546  methionine ABC transporter ATP-binding protein  54.4 
 
 		 405 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0858  methionine ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  52.45 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2174  methionine ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  50.14 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  49.24 
 
 		 351 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.88 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  50.46 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  52.32 
 
 		 354 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  47.01 
 
 		 377 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.46 
 
 		 368 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.6 
 
 		 359 aa  288  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  51.44 
 
 		 387 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  49.56 
 
 		 384 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  45.64 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  46.78 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  49.33 
 
 		 344 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.86 
 
 		 348 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  49.16 
 
 		 342 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.86 
 
 		 348 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  49.51 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2419  ABC transporter component  59.92 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.85 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04690  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  47.75 
 
 		 420 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  49.03 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.78 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.8 
 
 		 344 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2298  ABC transporter related  48.77 
 
 		 338 aa  278  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.49 
 
 		 343 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.49 
 
 		 343 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.49 
 
 		 343 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.49 
 
 		 343 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  48.37 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.48 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.49 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  46.2 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  46.2 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.2 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.2 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.2 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.77 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1772  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.2 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  46.2 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.2 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  44.57 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.2 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4331  NLPA lipoprotein  49.85 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0798419  normal  0.109457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.87 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1908  ABC transporter-like protein  54.55 
 
 		 318 aa  276  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.103908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.36 
 
 		 385 aa  275  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.24 
 
 		 352 aa  275  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2301  ABC transporter related  56.81 
 
 		 392 aa  275  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.61 
 
 		 343 aa  275  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  61.04 
 
 		 274 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  50.3 
 
 		 353 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0412  ABC transporter related  48.53 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  50.3 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5613  ABC transporter related  52.33 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.370742 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.96 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.6 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4306  ABC transporter related  47.4 
 
 		 377 aa  272  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.38 
 
 		 344 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2001  methionine transport ATP-binding protein  44.77 
 
 		 351 aa  271  9e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.974934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.8 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.67 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>