More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3432 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3432  quinone oxidoreductase  100 
 
 		 320 aa  628  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1347  alcohol dehydrogenase  47.37 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0674  alcohol dehydrogenase  49.15 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31757 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  47.22 
 
 		 324 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  48.45 
 
 		 322 aa  262  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.34 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  44.58 
 
 		 329 aa  251  9.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6194  alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.49 
 
 		 324 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  42.11 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  41.49 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  41.49 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  41.49 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.49 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  41.49 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  41.49 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.13 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.41 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  41.8 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  43.65 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0875  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.05 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.13 
 
 		 326 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.78 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4513  alcohol dehydrogenase  48.42 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5962  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.19 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0181365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.26 
 
 		 323 aa  235  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.57 
 
 		 331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4667  alcohol dehydrogenase  48.42 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3701  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.42 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1156  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.52 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00489379  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5633  alcohol dehydrogenase  48.1 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  40.56 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4057  alcohol dehydrogenase  47.78 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00526605  normal  0.609446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  40.99 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.02 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.92 
 
 		 323 aa  228  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  43.63 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.87 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  45.58 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.67 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.34 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  42.57 
 
 		 324 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.4 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3799  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.17 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0978462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1614  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.22 
 
 		 260 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3912  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.17 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.25 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  41.41 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.96 
 
 		 324 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  40.56 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  43.26 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.36 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3409  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.17 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.23 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  41.72 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  41.4 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  40.13 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 		 326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.18 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  40.57 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  41.95 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1703  alcohol dehydrogenase  46.5 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 		 326 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  40.43 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  37.96 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.08 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  37.96 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  37.96 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  37.96 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  37.96 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  37.96 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  41.91 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  39.49 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.08 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.42 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>