More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1562 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1562  glutathione S-transferase related protein  100 
 
 		 198 aa  411  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.572147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0785  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.49 
 
 		 202 aa  279  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.238617  normal  0.0753849 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1089  Glutathione S-transferase domain  60.1 
 
 		 198 aa  254  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600559  hitchhiker  0.000151531 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2584  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.42 
 
 		 199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0693  glutathione S-transferase family protein  55.31 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0702  glutathione S-transferase family protein  55.31 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0322  glutathione S-transferase-like  40.93 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  36.27 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  34.2 
 
 		 202 aa  117  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.46 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.56 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  34.2 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1590  Glutathione S-transferase domain protein  37.63 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  36.14 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2111  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.65 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.7 
 
 		 199 aa  107  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  32.29 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3279  putative glutathione S-transferase family protein  35.6 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  36.17 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.64 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  30.57 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.46 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  34.08 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4086  glutathione S-transferase-like  34.68 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  35.29 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  31.09 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0171  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.3 
 
 		 200 aa  98.2  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  38.37 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.63 
 
 		 221 aa  97.1  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2181  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  35.61 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4235  glutathione S-transferase-like protein  32.37 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1346  glutathione S-transferase-like  32.75 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 		 203 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  32.09 
 
 		 207 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  32.45 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  31.98 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.96 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  35.6 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  31.91 
 
 		 209 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  30.41 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  32.62 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  30.81 
 
 		 202 aa  91.3  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  30.81 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.51 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3271  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.87 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.68 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  34.64 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  30.89 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5879  Glutathione S-transferase domain protein  32.12 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.47 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  31.15 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  32.39 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  31.32 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  31.89 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1322  glutathione S-transferase-like protein  32.97 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0363606  normal  0.491489 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6155  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  31.22 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  31.49 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1204  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.43 
 
 		 206 aa  84.7  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  30.43 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  32.28 
 
 		 203 aa  84.7  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  30.81 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  32.8 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  32.8 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  32.8 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  32.8 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  32.8 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  32.8 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  30.86 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  32.8 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.27 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0859  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.53 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3228  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.87 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0668  Glutathione S-transferase domain  28.65 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0177  glutathione S-transferase family protein  32.37 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0356  Glutathione S-transferase domain  32.37 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1206  putative glutathione S-transferase  29.82 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0664  glutathione S-transferase family protein  29.12 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0473248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.26 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4031  putative glutathione S-transferase  27.84 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  31.36 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3898  putative glutathione S-transferase  32.35 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3819  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.89 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.538317 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0944  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.85 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.148191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0810  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.89 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3637  Glutathione S-transferase domain protein  29.89 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.455595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>