231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0985 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0985  divalent cation transporter  100 
 
 		 331 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0554  Mg2 transporter protein CorA family protein  61.03 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0599  Mg2 transporter protein CorA family protein  60.42 
 
 		 331 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0357357  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1278  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34.64 
 
 		 347 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0707161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1736  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34.16 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0741818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1498  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.22 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4248  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.16 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0457  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.22 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2010  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.29 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.313618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5567  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.03 
 
 		 356 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.92 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1774  Mg2+ transporter protein, CorA-like  31.92 
 
 		 355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40270  putative cation transporter  31.48 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3701  cation transporter, putative  30.74 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2126  hypothetical protein  27.62 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0748  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.76 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04870  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.51 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4318  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.62 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  30.38 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0549  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  29.67 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5383  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.81 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.600829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2904  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.12 
 
 		 370 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407019  normal  0.898383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0396  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.84 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0462  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.71 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0423  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.84 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515411 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2617  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.15 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0488  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.15 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1067  CorA family protein  27.22 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0226  CorA family protein  27.22 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0057  Mg2+/Co2+ transporter  27.22 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0361  Mg2+/Co2+ transporter  27.22 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1732  Mg2+ and Co2+ transporters  27.22 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1643  Mg2+/Co2+ transporter  27.22 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1224  Mg2+/Co2+ transporter  27.22 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297825  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3578  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.76 
 
 		 372 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2765  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.52 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6749  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.52 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1851  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.54 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0103716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3618  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.83 
 
 		 362 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000031468 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1621  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  25.74 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2558  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.83 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2830  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.07 
 
 		 320 aa  92.8  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4020  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.01 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3048  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.28 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0102286  normal  0.474894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1906  Mg2+/Co+2/Zn+2 transporter, CorA-like  26.71 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41630  putative cytoplasmic membrane-associated protein  26.13 
 
 		 332 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3533  hypothetical protein  25.3 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3316  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.08 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2609  zinc transporter  25.53 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.590272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2621  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  25.51 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.533199  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0935  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.06 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0018  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.93 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000124809  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1603  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.33 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  decreased coverage  0.000000000150807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1773  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.33 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3656  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.41 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000861188  hitchhiker  0.00000222917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.41 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000270616  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3715  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.41 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1799  zinc transporter  22.96 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2530  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  22.49 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0790  Mg2+ transporter  27.41 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000404579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0552  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.24 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1596  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.28 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180854  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2085  cmaX protein  25.54 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10467  normal  0.016656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1907  zinc transporter  22.96 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.250715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3655  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  25.54 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561597  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2390  zinc transporter  22.96 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0125  magnesium transporter, putative  23.69 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1772  zinc transporter  25 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3665  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.75 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00199439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2295  cmaX protein  25.97 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4137  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.95 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  hitchhiker  0.000000000148264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0644  magnesium transporter, putative  26 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.34 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2647  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  29.3 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.75 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0618  Mg2 transporter protein, CorA family protein  32.35 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1737  zinc transporter  23.33 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2318  zinc transporter  25.99 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04171  magnesium and cobalt transport protein  24.22 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1691  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.39 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.45 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2600  zinc transporter  25.99 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0681  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.48 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1840  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2093  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.87 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1678  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  0.0898182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1777  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.342474  normal  0.102835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1496  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.05 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1780  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0977223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47640  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.19 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.505114  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0113  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.03 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453825  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3984  magnesium transporter, putative  23.67 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2144  zinc transporter  22.82 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2302  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.77 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0640484  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1556  zinc transporter  22.77 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1780  zinc transporter  22.77 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1459  zinc transporter  22.77 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3367  Mg2 transporter protein, CorA family protein  31.2 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00335371  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2283  zinc transporter  22.77 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>