22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0073 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  100 
 
 
313 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  34.94 
 
 
660 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  42.5 
 
 
187 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  41.67 
 
 
187 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  41.67 
 
 
187 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  32.62 
 
 
481 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  32.3 
 
 
658 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  33.33 
 
 
557 aa  79  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.9 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  31.82 
 
 
451 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  33.59 
 
 
597 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
450 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  29.61 
 
 
520 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  25.98 
 
 
449 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  33.81 
 
 
569 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  32 
 
 
548 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  29.92 
 
 
1414 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  31.78 
 
 
1421 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5345  hypothetical protein  28.38 
 
 
375 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  25.41 
 
 
824 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  26.56 
 
 
836 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  26.42 
 
 
2123 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>