74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4072 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4072  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 
80 aa  164  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  63.16 
 
 
76 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  58.44 
 
 
77 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0677  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.44 
 
 
77 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4190  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  59.74 
 
 
77 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.806772  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.74 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417972  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  59.74 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.969084  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4883  putative ferredoxin  57.14 
 
 
77 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169548  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3162  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.15 
 
 
81 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5012  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.15 
 
 
81 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  56.76 
 
 
81 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1479  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.84 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1973  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.41 
 
 
81 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6104  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.41 
 
 
81 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5288  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  54.05 
 
 
81 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.782627  normal  0.0624847 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.7 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.7 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141555  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  57.75 
 
 
81 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.623695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.7 
 
 
81 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.05 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.7 
 
 
81 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.7 
 
 
81 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394196  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.95 
 
 
77 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.65 
 
 
77 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0565502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.51 
 
 
687 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 
699 aa  48.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  37.7 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3660  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  39.29 
 
 
256 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  43.94 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  43.08 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.7 
 
 
370 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3521  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.68 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  43.94 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.42 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.14 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.43 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2223  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.454145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.84 
 
 
502 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  40.38 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  38.33 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1283  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 
566 aa  42.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.82 
 
 
338 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2467  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.14 
 
 
285 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  34.43 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0679  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.27 
 
 
717 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  34.43 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3732  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
743 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.62401 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3718  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.19 
 
 
256 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0184008  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0491  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.85 
 
 
332 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.6 
 
 
749 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16840  4Fe-4S protein  38.46 
 
 
316 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34622  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.51 
 
 
314 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  34.55 
 
 
507 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112658  normal  0.013412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2764  4Fe-4S ferredoxin  39.68 
 
 
726 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  34.55 
 
 
507 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3786  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  33.93 
 
 
256 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.312558 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0776  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.21 
 
 
253 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0591  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 
390 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463263  normal  0.063336 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00500  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  45.45 
 
 
206 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.791376  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.32 
 
 
1487 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  39.13 
 
 
1299 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2172  cyclic nucleotide-binding protein  35.71 
 
 
565 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653365  hitchhiker  0.000000233561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0600  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.6 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 
559 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0098001  normal  0.0322264 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  36.11 
 
 
408 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0496  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.35 
 
 
672 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.747428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.66 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2384  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.48 
 
 
208 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.238781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  37.78 
 
 
644 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1841  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.84 
 
 
139 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000340892  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.68 
 
 
145 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>