25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0421 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3211  hypothetical protein  67.14 
 
 		 210 aa  265  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  61.35 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  60.29 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  28.5 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  30.22 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  29.5 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  33.87 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  38.71 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  31.87 
 
 		 304 aa  52  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  34.4 
 
 		 328 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  31.82 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  31.82 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  30.71 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  30 
 
 		 303 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  37.84 
 
 		 360 aa  49.7  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  29.75 
 
 		 304 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  32.73 
 
 		 303 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  32.35 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  32.56 
 
 		 308 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1043 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  26.39 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  26.39 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  30.1 
 
 		 300 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  29.41 
 
 		 324 aa  41.6  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>