26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3664 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  507  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35980  hypothetical protein  33.06 
 
 
264 aa  113  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  41.67 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2823  hypothetical protein  31.43 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00350669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4518  hypothetical protein  29.45 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5028  hypothetical protein  29.45 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.207071  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  27.16 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  32.32 
 
 
216 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  40 
 
 
211 aa  53.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  24.71 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  36.71 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  37.68 
 
 
212 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  25.37 
 
 
275 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  34.78 
 
 
212 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  34.78 
 
 
212 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  23.61 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  35.37 
 
 
331 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  27.36 
 
 
212 aa  45.4  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  27.61 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  27.33 
 
 
199 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  36.97 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  29.46 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  30.33 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  25.24 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  32.79 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  25.31 
 
 
228 aa  42  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>