24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3551 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3551  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  447  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  61.08 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1063  putative integral membrane protein  59.45 
 
 
231 aa  227  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  55.56 
 
 
254 aa  205  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2467  hypothetical protein  54.77 
 
 
273 aa  204  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128943  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  29.56 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  29.28 
 
 
217 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  29.28 
 
 
217 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  28.22 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  29.86 
 
 
227 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  23.68 
 
 
214 aa  52  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  27.07 
 
 
308 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  33.18 
 
 
212 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  35.26 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  29.41 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  29.81 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  29.94 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  29.19 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  32.93 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  26.44 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  25.77 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  27.81 
 
 
275 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  31.94 
 
 
260 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  28.73 
 
 
251 aa  42  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>