41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3262 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3262  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
237 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3057  protein tyrosine/serine phosphatase  59.49 
 
 
239 aa  296  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  42.67 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0661  protein tyrosine/serine phosphatase  32.63 
 
 
244 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  32.02 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1917  protein tyrosine/serine phosphatase  33.2 
 
 
258 aa  82  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.465769  normal  0.598754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  32.48 
 
 
234 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  29.69 
 
 
249 aa  72  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0714  protein tyrosine/serine phosphatase  29.63 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  32.9 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  28.48 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  32.39 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1584  protein tyrosine/serine phosphatase  28.92 
 
 
227 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  30.23 
 
 
636 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  28.22 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  35.53 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2407  protein tyrosine/serine phosphatase  32.19 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  24.9 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  31.71 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  29.55 
 
 
253 aa  48.5  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  37.96 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  23.98 
 
 
270 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  32.35 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  26.88 
 
 
289 aa  46.6  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  47.83 
 
 
298 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  25.16 
 
 
238 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  21.37 
 
 
264 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  27.46 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  31.46 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0178  protein tyrosine/serine phosphatase  25.36 
 
 
395 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  27.89 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  27.82 
 
 
637 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  27.16 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09355  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543229  normal  0.0103312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  25.71 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  27.4 
 
 
283 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  24.4 
 
 
269 aa  42  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  30.37 
 
 
251 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  25 
 
 
255 aa  42  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>