More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1650 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1650  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
340 aa  692    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358595  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1642  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  69.71 
 
 
341 aa  455  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000365372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06650  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  55.03 
 
 
356 aa  351  1e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1526  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  53.1 
 
 
349 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458985  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4897  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  52.66 
 
 
346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2122  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.89 
 
 
345 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2431  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  52.23 
 
 
353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0305865  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1205  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.3 
 
 
349 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902231  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1178  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.612504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1195  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13427  nucleoside hydrolase iunH (purine nucleosidase)  44.38 
 
 
308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00808696  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23440  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  40.73 
 
 
324 aa  237  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0476594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3809  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.26 
 
 
328 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.69 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.42 
 
 
338 aa  155  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.32 
 
 
322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  31.2 
 
 
315 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.8 
 
 
341 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03204  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  32.53 
 
 
313 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  33.03 
 
 
310 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  32.53 
 
 
318 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.45 
 
 
311 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  32.02 
 
 
318 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  31.72 
 
 
318 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  31.72 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.94 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  31.94 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.94 
 
 
315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0528  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  28.44 
 
 
327 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3506  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.57 
 
 
311 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.5 
 
 
311 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  31.95 
 
 
309 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  29.59 
 
 
332 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  29.59 
 
 
332 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  32.62 
 
 
311 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  32.32 
 
 
311 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  32.93 
 
 
311 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  32.45 
 
 
313 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  32.62 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  32.32 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  32.32 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  32.32 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  32.32 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  32.32 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  32.32 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  32.32 
 
 
311 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  32.32 
 
 
311 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  31.12 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  34.82 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  31.8 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.47 
 
 
313 aa  139  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  30.91 
 
 
318 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  32.01 
 
 
311 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  31.34 
 
 
312 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  33.93 
 
 
313 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.95 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  32.38 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  29.48 
 
 
323 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  30.61 
 
 
318 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.25 
 
 
314 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  30.61 
 
 
318 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1071  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.83 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  30.9 
 
 
314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  30.61 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.41 
 
 
324 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  32.57 
 
 
312 aa  135  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  33.01 
 
 
355 aa  135  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0759  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  29.82 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.486217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  33.33 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3859  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.43 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  28.87 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1356  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.86 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1475  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.46 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0546979  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  30.49 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  28.57 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  30.58 
 
 
335 aa  133  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.07 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3255  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.78 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.44 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  29.85 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1896  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.86 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00667656  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.4 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2260  IUNH family nucleoside hydrolase  26.97 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0651  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.11 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  33.12 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03052  hypothetical protein  33.56 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  31.9 
 
 
314 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  29.97 
 
 
322 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  27.81 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1122  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.79 
 
 
324 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1962  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.33 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.91 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2680  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.53 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.81 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  27.91 
 
 
311 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1971  IUNH family nucleoside hydrolase  27.27 
 
 
326 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.260258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4422  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.42 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3900  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.61 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.52 
 
 
308 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>