44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1329 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  76.03 
 
 		 333 aa  441  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6497  protein of unknown function DUF606  46.05 
 
 		 330 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  44.18 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  37.58 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  37.42 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  37.42 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  37.42 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  37.42 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  37.42 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0819  hypothetical protein  47.24 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0874  hypothetical protein  48.38 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  38.31 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1512  protein of unknown function DUF606  35.47 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.777644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  29.93 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  24.26 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  31.88 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  24.37 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  24.37 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  24.52 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  30.41 
 
 		 146 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  31.43 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  32.48 
 
 		 172 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5701  hypothetical protein  31.16 
 
 		 145 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  31.47 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  32.85 
 
 		 156 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  31.3 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  34.75 
 
 		 144 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  27.66 
 
 		 148 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  28.86 
 
 		 151 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  33.64 
 
 		 174 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  29.37 
 
 		 146 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  32.35 
 
 		 152 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  29.85 
 
 		 147 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  32.24 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  29.29 
 
 		 147 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  29.06 
 
 		 146 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6653  protein of unknown function DUF606  29.71 
 
 		 144 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508565  normal  0.0277102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  31.01 
 
 		 144 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  30.22 
 
 		 148 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  33.55 
 
 		 153 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  30.5 
 
 		 148 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  30.43 
 
 		 149 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>