37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1185 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  100 
 
 		 315 aa  649    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  29.52 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  29.49 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  27.97 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  28.51 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  26.4 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  30.11 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  25.76 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  28.52 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  26.46 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  30.05 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  26.46 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  26.96 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  29.44 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  27.47 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  21.49 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  24.46 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  28.63 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  25.24 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  24.08 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  28.17 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  26.24 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  26.52 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  26.09 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  22.87 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  24.79 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  25.27 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.81 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  24.71 
 
 		 410 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  21.78 
 
 		 416 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  23.33 
 
 		 421 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  23.33 
 
 		 421 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  21.98 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  19.61 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  26.53 
 
 		 445 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  26.53 
 
 		 445 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0468  hypothetical protein  29.2 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>