126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0308 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  100 
 
 
786 aa  1607    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  46.41 
 
 
848 aa  641    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  46.45 
 
 
843 aa  653    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  46.22 
 
 
825 aa  642    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  80.84 
 
 
767 aa  1298    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  80.69 
 
 
781 aa  1308    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  48.74 
 
 
834 aa  660    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  45.17 
 
 
858 aa  618  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  44.34 
 
 
795 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  43.56 
 
 
795 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  41.61 
 
 
790 aa  568  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  42.09 
 
 
795 aa  568  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  41.22 
 
 
790 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  34.96 
 
 
780 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  38.42 
 
 
807 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  39.15 
 
 
784 aa  476  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  37.89 
 
 
791 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  33.97 
 
 
781 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  37.83 
 
 
786 aa  466  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  37.48 
 
 
791 aa  469  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  37.9 
 
 
789 aa  465  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  37.64 
 
 
800 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  38.22 
 
 
824 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  36.82 
 
 
786 aa  458  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  35.85 
 
 
804 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  37.76 
 
 
784 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  32.99 
 
 
780 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  36.31 
 
 
794 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  37.52 
 
 
787 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  37.32 
 
 
786 aa  443  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  36.58 
 
 
780 aa  442  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  34.52 
 
 
778 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  36.03 
 
 
787 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  36.03 
 
 
787 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  36.03 
 
 
787 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  37.09 
 
 
810 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  34.75 
 
 
789 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  36.07 
 
 
790 aa  425  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  34.53 
 
 
788 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  35.98 
 
 
778 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  34.15 
 
 
777 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  32.82 
 
 
986 aa  330  7e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  39.38 
 
 
782 aa  325  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  26.78 
 
 
805 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  27.64 
 
 
780 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  27.71 
 
 
750 aa  281  4e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  28.91 
 
 
755 aa  276  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  28.91 
 
 
755 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  28.78 
 
 
755 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  28.91 
 
 
755 aa  273  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  28.91 
 
 
755 aa  273  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  27.4 
 
 
765 aa  273  1e-71  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  27.93 
 
 
755 aa  269  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  27.05 
 
 
758 aa  268  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  28.38 
 
 
755 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  28.34 
 
 
755 aa  267  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  28.78 
 
 
757 aa  266  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  28.36 
 
 
755 aa  264  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  27.08 
 
 
763 aa  261  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.99 
 
 
749 aa  261  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  28.46 
 
 
748 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  27.48 
 
 
965 aa  258  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  29.49 
 
 
761 aa  258  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  29.23 
 
 
761 aa  257  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  26.34 
 
 
787 aa  256  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  25.53 
 
 
775 aa  256  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  26.13 
 
 
978 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  26.51 
 
 
794 aa  250  6e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  28.53 
 
 
710 aa  249  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  26.79 
 
 
789 aa  247  6e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  25.79 
 
 
768 aa  247  6.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  27.6 
 
 
751 aa  246  9e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.1 
 
 
778 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  27.92 
 
 
720 aa  243  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  34.22 
 
 
760 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  27.13 
 
 
774 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  25.77 
 
 
807 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  27.07 
 
 
787 aa  234  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  27.41 
 
 
752 aa  234  4.0000000000000004e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  26.21 
 
 
767 aa  234  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.74 
 
 
762 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  25.5 
 
 
781 aa  233  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.44 
 
 
759 aa  233  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 
759 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  27.22 
 
 
771 aa  230  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  34.22 
 
 
777 aa  228  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  24.94 
 
 
769 aa  223  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.75 
 
 
1053 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  27.52 
 
 
752 aa  217  5e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  33.18 
 
 
704 aa  211  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  27.28 
 
 
776 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.97 
 
 
1051 aa  206  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.77 
 
 
1050 aa  204  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.06 
 
 
1051 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.79 
 
 
1053 aa  201  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  26.49 
 
 
807 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.91 
 
 
1052 aa  195  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.33 
 
 
1055 aa  194  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  24.78 
 
 
748 aa  193  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.93 
 
 
807 aa  193  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>