More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1299 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1299  ribosomal protein L19  100 
 
 
115 aa  229  9e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0178063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 
114 aa  144  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 
115 aa  141  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
114 aa  140  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  58.04 
 
 
118 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
115 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  63.81 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0720  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  58.72 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 
113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  53.98 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0198  ribosomal protein L19  57.89 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000492639  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1023  ribosomal protein L19  55.86 
 
 
120 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00623227 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  54.05 
 
 
114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
117 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  53.1 
 
 
115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  56.25 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 
120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 
120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  55.45 
 
 
113 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  56.25 
 
 
114 aa  125  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
120 aa  124  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
114 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 
159 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  54.55 
 
 
117 aa  124  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
120 aa  124  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 
115 aa  124  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  52.99 
 
 
132 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 
116 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
131 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 
116 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
118 aa  123  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
116 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
159 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
116 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
116 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 
116 aa  123  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  53.21 
 
 
121 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  54.87 
 
 
116 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  55.36 
 
 
113 aa  122  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
116 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
156 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  51.26 
 
 
132 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
117 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
116 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
114 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
114 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 
130 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
114 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
156 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 
119 aa  121  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  53.78 
 
 
124 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  53.4 
 
 
141 aa  121  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  54.55 
 
 
116 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2277  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
118 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 
120 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
116 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2403  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 
115 aa  120  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 
116 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 
116 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
116 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  120  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  54.05 
 
 
124 aa  120  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 
137 aa  120  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1046  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 
134 aa  120  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000242174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 
128 aa  120  6e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  54.46 
 
 
118 aa  120  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  47.79 
 
 
115 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  53.15 
 
 
120 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
120 aa  120  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  50.85 
 
 
166 aa  120  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
115 aa  120  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  53.21 
 
 
117 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
114 aa  120  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>