More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1298 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  75.54 
 
 		 485 aa  727    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.09 
 
 		 468 aa  658    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.94 
 
 		 469 aa  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.94 
 
 		 469 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.94 
 
 		 469 aa  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  76.19 
 
 		 479 aa  732    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.82 
 
 		 470 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.72 
 
 		 469 aa  651    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.94 
 
 		 469 aa  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.82 
 
 		 470 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.53 
 
 		 473 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 462 aa  636    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.3 
 
 		 469 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1298  ATP synthase F1, beta subunit  100 
 
 		 493 aa  1007    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1045  ATP synthase F1, beta subunit  75.65 
 
 		 483 aa  702    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.711777  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.74 
 
 		 473 aa  649    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.09 
 
 		 468 aa  658    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.66 
 
 		 468 aa  652    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.66 
 
 		 468 aa  651    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.51 
 
 		 464 aa  658    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.75 
 
 		 469 aa  640    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.31 
 
 		 480 aa  635    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 		 466 aa  634    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 		 470 aa  632  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.78 
 
 		 472 aa  634  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  68.45 
 
 		 467 aa  632  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.39 
 
 		 465 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.17 
 
 		 465 aa  631  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 		 504 aa  634  1e-180  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.68 
 
 		 468 aa  632  1e-180  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 		 475 aa  629  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 471 aa  624  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 		 470 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  66.38 
 
 		 465 aa  624  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.95 
 
 		 470 aa  624  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 470 aa  618  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.89 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 468 aa  618  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  66.09 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.03 
 
 		 475 aa  617  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 468 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 464 aa  616  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 470 aa  614  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  67.81 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.16 
 
 		 465 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.89 
 
 		 481 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 		 471 aa  616  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.17 
 
 		 462 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.36 
 
 		 482 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 467 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  66.52 
 
 		 470 aa  611  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.39 
 
 		 462 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.17 
 
 		 462 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  63.94 
 
 		 487 aa  610  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 462 aa  608  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.37 
 
 		 475 aa  608  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 470 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.81 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 		 462 aa  610  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 482 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.02 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.4 
 
 		 476 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 		 467 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 479 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.23 
 
 		 465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.78 
 
 		 503 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  64.02 
 
 		 482 aa  603  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.39 
 
 		 474 aa  601  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.82 
 
 		 472 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1273  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.6 
 
 		 468 aa  599  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.08 
 
 		 474 aa  601  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  63.95 
 
 		 468 aa  601  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.66 
 
 		 465 aa  600  1e-170  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06104  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.99 
 
 		 461 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 472 aa  600  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.17 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1181  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.6 
 
 		 468 aa  599  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.186447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 		 460 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  65.15 
 
 		 460 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.39 
 
 		 475 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4196  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.94 
 
 		 460 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.16 
 
 		 483 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4075  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.94 
 
 		 460 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.999659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 		 460 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03560  hypothetical protein  65.15 
 
 		 460 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4146  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.94 
 
 		 460 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.38 
 
 		 481 aa  595  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  63 
 
 		 474 aa  597  1e-169  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.21 
 
 		 483 aa  597  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4484  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.48 
 
 		 482 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4189  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 		 460 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 		 471 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.37 
 
 		 484 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 		 460 aa  596  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.39 
 
 		 519 aa  595  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4503  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.48 
 
 		 482 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.36 
 
 		 464 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.5 
 
 		 464 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>