More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0363 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0363  ABC transporter related  100 
 
 		 219 aa  443  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0677  ABC transporter related  49.52 
 
 		 218 aa  217  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.012706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3979  ABC transporter related  47.12 
 
 		 214 aa  208  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0578  ABC transporter related  45.19 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2290  ABC transporter related protein  45.19 
 
 		 226 aa  191  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1165  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0053  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 		 214 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.633945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2537  ABC transporter related  41.63 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2589  ABC transporter related  41.63 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1569  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.83 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 331 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.49 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  36.49 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  36.49 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  36.49 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.14 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.59 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  35.19 
 
 		 303 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  36.87 
 
 		 409 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.79 
 
 		 329 aa  141  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 309 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  36.1 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 309 aa  138  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  38.18 
 
 		 307 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  38.68 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 309 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  35.48 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  37.5 
 
 		 254 aa  135  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 242 aa  134  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4661  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  35.07 
 
 		 326 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4660  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 		 307 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  38.16 
 
 		 306 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  34.6 
 
 		 316 aa  132  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  36.49 
 
 		 309 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 		 307 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  36.62 
 
 		 322 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  36.15 
 
 		 314 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4363  ABC transporter related  36.24 
 
 		 307 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  34.55 
 
 		 306 aa  131  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  33.03 
 
 		 304 aa  131  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  33.8 
 
 		 303 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  36.97 
 
 		 302 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  37.44 
 
 		 303 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  35.24 
 
 		 305 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4645  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 308 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2294  ABC transporter related  36.87 
 
 		 306 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 307 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1805  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.84 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  34.76 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4431  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 		 307 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 		 310 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4774  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 		 307 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0592  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 307 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 310 aa  129  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  35.07 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 318 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  34.86 
 
 		 312 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  35.55 
 
 		 346 aa  128  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 307 aa  128  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1988  ABC transporter related  34.6 
 
 		 290 aa  128  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.854169  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2021  ABC transporter related  34.6 
 
 		 290 aa  128  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 307 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 307 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 299 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.76 
 
 		 299 aa  127  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  34.74 
 
 		 309 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  33.03 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  35.2 
 
 		 346 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 		 305 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 		 305 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 		 305 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 		 305 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  33.81 
 
 		 305 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  33.17 
 
 		 304 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  33.04 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  36.11 
 
 		 318 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.27 
 
 		 944 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  37.44 
 
 		 297 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  33.8 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  34.47 
 
 		 897 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  38.07 
 
 		 320 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>