92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4505 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4505  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  100 
 
 
168 aa  332  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518738  normal  0.712691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4357  spoIIIJ-associated protein  69.28 
 
 
169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4513  spoIIIJ-associated protein  69.81 
 
 
169 aa  196  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4494  spoIIIJ-associated protein  69.18 
 
 
169 aa  194  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6896  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.86 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2670  SpoIIIJ-associated protein  30.57 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2234  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  33.8 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3325  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  30.13 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0161391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2993  R3H domain-containing protein  29.94 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3158  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  36.36 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.878334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2931  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  29.03 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000538907  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23570  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  32.64 
 
 
214 aa  70.9  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.10216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2148  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.13 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0706  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  31.79 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0014097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4366  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.88 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3942  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  31.75 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2366  single-stranded nucleic acid binding R3H  28.66 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2138  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  32.63 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.101522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1428  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  31.28 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.436492  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1108  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  31.08 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00153478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3487  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.94 
 
 
210 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1197  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  34.04 
 
 
221 aa  64.3  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000457064  hitchhiker  0.000925706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3964  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  31.01 
 
 
229 aa  64.3  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731182  normal  0.0938919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1916  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  34.78 
 
 
430 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224043  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0069  single-stranded nucleic acid binding R3H  31.21 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0887  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  29.01 
 
 
498 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00650736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5946  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  29.33 
 
 
155 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5612  jag protein  24.39 
 
 
205 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.619797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5323  jag protein  24.39 
 
 
205 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.122987 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4025  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  26.22 
 
 
205 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1536  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.57 
 
 
203 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116594  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5278  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  25.31 
 
 
205 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0763  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  35.79 
 
 
240 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.238537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3559  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  29.01 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5182  Jag protein (SpoIIIJ-associated protein)  25.93 
 
 
205 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0241441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5595  jag protein  25.93 
 
 
205 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5166  jag protein (SpoIIIJ-associated protein)  25.93 
 
 
205 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5338  jag protein  25.93 
 
 
205 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5735  jag protein  25.93 
 
 
205 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3933  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  38.3 
 
 
188 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000105955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2410  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  27.66 
 
 
206 aa  58.2  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000733307  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2034  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.72 
 
 
281 aa  57.8  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4958  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  32.76 
 
 
212 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000279065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2520  single-stranded nucleic acid binding R3H  27.4 
 
 
206 aa  57.8  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.885926  hitchhiker  0.000525149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1423  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  34 
 
 
251 aa  57.4  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5636  jag protein  30.33 
 
 
205 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1365  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  37.23 
 
 
194 aa  57.8  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.856474  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2598  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  28.28 
 
 
226 aa  57.4  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434247  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1788  DNA/RNA-binding protein  29.05 
 
 
349 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000347155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0103  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  28.83 
 
 
341 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0893  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.93 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5672  jag protein  25.31 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3430  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  26.75 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3212  single-stranded nucleic acid binding R3H  35.79 
 
 
228 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2946  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.4 
 
 
216 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000137296  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2393  single-stranded nucleic acid binding R3H  30.93 
 
 
437 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152016  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1941  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  25 
 
 
255 aa  54.7  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000134575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4168  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  35.11 
 
 
188 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14170  predicted RNA-binding protein  30.53 
 
 
206 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1966  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  26.32 
 
 
455 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.452949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2759  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.95 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000230158  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0130  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  28.48 
 
 
204 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31940  predicted RNA-binding protein  31.63 
 
 
232 aa  50.8  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4711  single-stranded nucleic acid binding R3H  30.25 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.939144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5264  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.91 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.0656004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4981  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  34.02 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28510  predicted RNA-binding protein  33.68 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00371448  hitchhiker  0.001116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3436  single-stranded nucleic acid binding R3H  22.7 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.948482  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0607  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  22 
 
 
217 aa  47.8  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000089602  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6483  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  29.91 
 
 
176 aa  47.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0896384 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0410  R3H domain-containing protein  20.57 
 
 
273 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27000  predicted RNA-binding protein  33 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3120  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  29.17 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000729653  hitchhiker  0.0000000587752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3592  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  29.08 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0216  single-stranded nucleic acid binding R3H  26.61 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.154539  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2573  single-stranded nucleic acid binding R3H  30.77 
 
 
209 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39760  predicted RNA-binding protein  29.9 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4098  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  31.2 
 
 
162 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4059  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.93 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_909  RNA-binding protein  38.36 
 
 
226 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000072438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9386  spoIIIJ-associated protein  27.62 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0921  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  38.36 
 
 
226 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000101944  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3113  single-stranded nucleic acid binding R3H  26.9 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2554  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.87 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000217074  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1352  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  20.71 
 
 
221 aa  42.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1334  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  20.71 
 
 
221 aa  42.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000542188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0118  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  24.83 
 
 
207 aa  42  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1039  SpoIIIJ-associated protein Jag, putative  36.99 
 
 
226 aa  42  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00710769  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1037  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  22.82 
 
 
226 aa  41.2  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.220357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4864  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  29.25 
 
 
162 aa  41.2  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0104759  hitchhiker  0.00517624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0688  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  26.73 
 
 
177 aa  40.8  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3375  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  31.63 
 
 
173 aa  40.8  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>