88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3521 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3521  polysulphide reductase NrfD  100 
 
 
405 aa  783    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.625626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3972  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  43.23 
 
 
386 aa  316  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158247  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3524  polysulphide reductase NrfD  46.41 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.902311  normal  0.369035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1125  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  42.4 
 
 
435 aa  309  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3137  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  41.42 
 
 
446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0146  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  42.11 
 
 
421 aa  305  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1945  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  42.33 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0784  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  41.12 
 
 
442 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2504  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  42.42 
 
 
382 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0524  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  42.2 
 
 
416 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.920848  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4090  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  41.03 
 
 
388 aa  289  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0479  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  38.3 
 
 
415 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0512  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  38.56 
 
 
415 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0507  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  38.56 
 
 
415 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3422  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  40.5 
 
 
392 aa  270  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3464  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  40.5 
 
 
392 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4307  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  40.5 
 
 
392 aa  269  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3281  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  40.5 
 
 
392 aa  269  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0698  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  40.5 
 
 
392 aa  269  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3175  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  40.5 
 
 
392 aa  269  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02820  hypothetical protein  40.5 
 
 
392 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0701  Polysulphide reductase NrfD  40.5 
 
 
392 aa  269  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02871  predicted hydrogenase 2 cytochrome b type component  40.5 
 
 
392 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3395  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  39.5 
 
 
392 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3401  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  39.5 
 
 
392 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3330  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  39.5 
 
 
392 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353265  normal  0.837141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3321  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  39.5 
 
 
392 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.437559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3496  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  39.5 
 
 
392 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1412  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  42.04 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2532  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  41.51 
 
 
399 aa  250  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1984  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  35.47 
 
 
414 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00764136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2236  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  36.55 
 
 
414 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.263965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4239  nickel-dependent hydrogenase, membrane protein  34.13 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442151  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  33.7 
 
 
398 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  34.6 
 
 
401 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0170  Polysulphide reductase NrfD  33.59 
 
 
378 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0292  Polysulphide reductase NrfD  34.1 
 
 
396 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.468469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  34.82 
 
 
401 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  32.9 
 
 
403 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0875  Polysulphide reductase NrfD  34.33 
 
 
402 aa  179  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.946275  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  31.78 
 
 
403 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  31.61 
 
 
403 aa  176  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2252  polysulphide reductase NrfD  33.59 
 
 
402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.38952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  32.47 
 
 
403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  32.07 
 
 
403 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  31.42 
 
 
403 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4619  Polysulphide reductase NrfD  33.06 
 
 
416 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1116  polysulphide reductase, NrfD  32.8 
 
 
386 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0461  putative hydrogenase cytochrome b subunit  31.37 
 
 
381 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1801  polysulphide reductase NrfD  34.67 
 
 
408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2943  polysulphide reductase, NrfD  31.58 
 
 
394 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.486448  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0570  Polysulphide reductase NrfD  32.56 
 
 
389 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2596  Polysulphide reductase NrfD  32.38 
 
 
388 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2040  Polysulphide reductase NrfD  30.41 
 
 
404 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.918159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2407  polysulphide reductase, NrfD  31.98 
 
 
388 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0651  hmc operon protein 3  31.43 
 
 
389 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.958991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1198  Polysulphide reductase NrfD  32.22 
 
 
400 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2006  polysulphide reductase, NrfD  30.57 
 
 
403 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1957  Polysulphide reductase NrfD  30.08 
 
 
403 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1872  Polysulphide reductase NrfD  29.61 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0160  polysulphide reductase, NrfD  30.62 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1578  putative hydrogenase cytochrome b subunit  27.81 
 
 
394 aa  126  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.534156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1044  putative hydrogenase cytochrome b subunit  26.82 
 
 
401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.82 
 
 
744 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.99 
 
 
729 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2087  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.19 
 
 
731 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.61 
 
 
731 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1869  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.61 
 
 
731 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.856186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0677  polysulphide reductase-like protein  26.23 
 
 
451 aa  87  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.56556e-16 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  26.88 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  26.95 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0664  polysulphide reductase-like protein  25.32 
 
 
451 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  32.32 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1704  polysulphide reductase-like protein  27.02 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.990037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3654  polysulphide reductase-like protein  25 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  32.53 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  29.7 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2549  polysulphide reductase NrfD  29.27 
 
 
410 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0608  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  27.54 
 
 
417 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0543645  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  23.92 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  25.55 
 
 
445 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  28.17 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  24.17 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  25.12 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  23.62 
 
 
388 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  26.81 
 
 
414 aa  43.5  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  27.35 
 
 
384 aa  43.5  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>