86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2941 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
508 aa  980    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  41.61 
 
 
467 aa  351  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  39.35 
 
 
476 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  33.91 
 
 
474 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  36.92 
 
 
468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  33.8 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  26.74 
 
 
464 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  30.91 
 
 
462 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  32.06 
 
 
454 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  32.75 
 
 
461 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  30.35 
 
 
462 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  26.23 
 
 
454 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  31.43 
 
 
454 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  32.49 
 
 
458 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  31.21 
 
 
456 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  30.19 
 
 
455 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  31.11 
 
 
454 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  32.13 
 
 
459 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  29.56 
 
 
462 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  26.17 
 
 
538 aa  87  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  26.15 
 
 
524 aa  84.7  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  30.75 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  25.23 
 
 
520 aa  81.3  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  29.91 
 
 
473 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  25.69 
 
 
324 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  24.14 
 
 
394 aa  53.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  31.74 
 
 
506 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  43.28 
 
 
490 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  28.14 
 
 
439 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0951  small GTP-binding protein  30.77 
 
 
201 aa  47.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  29.05 
 
 
448 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14900  GTP-binding protein HSR1-related  39.33 
 
 
199 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.527689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  30.77 
 
 
495 aa  47  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 
447 aa  47  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  30.61 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29397  predicted protein  30.87 
 
 
253 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000110123  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  28.16 
 
 
498 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0374  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  41.94 
 
 
254 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0899895 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  29.01 
 
 
455 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7093  small GTP-binding protein  35.94 
 
 
202 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000783147  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1817  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.37 
 
 
194 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  42.11 
 
 
496 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  32.84 
 
 
614 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  28 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1924  ribosome-associated GTPase EngA  29.05 
 
 
515 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00693706  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  40.32 
 
 
443 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  39.71 
 
 
205 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.034569  normal  0.192806 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  27.4 
 
 
321 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5600  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.71 
 
 
259 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  24.86 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  28 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3115  GTP-binding protein EngA  30.46 
 
 
496 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241248 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0012  GTP-binding protein  42.37 
 
 
227 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0983  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  39.34 
 
 
253 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147183  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  41.94 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1494  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  36.84 
 
 
191 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0771  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.71 
 
 
245 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  29.68 
 
 
516 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  26.9 
 
 
490 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  28 
 
 
446 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  28.07 
 
 
478 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  27.31 
 
 
462 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  42.19 
 
 
348 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0689  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  37.1 
 
 
218 aa  44.3  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.184311  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0443  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.65 
 
 
200 aa  44.3  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.793464  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2599  tRNA modification GTPase TrmE  38.67 
 
 
437 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.157289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3190  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  37.1 
 
 
207 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.643787  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 
456 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  26.95 
 
 
446 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2503  GTP-binding protein EngA  30.06 
 
 
461 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  40.32 
 
 
441 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  29.27 
 
 
709 aa  44.3  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.41 
 
 
464 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0709  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  37.1 
 
 
262 aa  44.3  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2981  ribosome-associated GTPase EngA  24.28 
 
 
447 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  27.7 
 
 
531 aa  44.3  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 
314 aa  43.9  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 
337 aa  43.9  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 
337 aa  43.9  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  27.59 
 
 
498 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  26.72 
 
 
455 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2826  small GTP-binding protein  33.55 
 
 
463 aa  43.9  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000744132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  38.37 
 
 
454 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  40.98 
 
 
466 aa  43.5  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  37.7 
 
 
448 aa  43.5  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0898  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.61 
 
 
204 aa  43.5  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>