28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0051 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0027  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R36  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  89.09 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0047  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0003  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  hitchhiker  0.00000072706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0911  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0572  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>