13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Leu-3 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  90.36 
 
 
86 bp  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  92.86 
 
 
83 bp  60  0.00000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  93.33 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0572  tRNA-Leu  90.24 
 
 
83 bp  50.1  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  88.89 
 
 
83 bp  50.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0041  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0052  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.43 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  92.11 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>