34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2164 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2164  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 1233 aa  2531    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0772652  normal  0.613153 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0953  sulfatase  42.27 
 
 		 1414 aa  155  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.462358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.79 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  22.1 
 
 		 388 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  22.07 
 
 		 373 aa  56.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  24.35 
 
 		 536 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  23.14 
 
 		 1115 aa  52  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  23.34 
 
 		 463 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.86 
 
 		 864 aa  51.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.04 
 
 		 585 aa  51.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 578 aa  50.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  22.51 
 
 		 366 aa  50.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  21.83 
 
 		 499 aa  50.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  24.54 
 
 		 541 aa  49.3  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  22.47 
 
 		 430 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  22.71 
 
 		 430 aa  48.5  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  22.71 
 
 		 430 aa  48.5  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  22.85 
 
 		 430 aa  48.5  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  22.85 
 
 		 430 aa  48.5  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  22.84 
 
 		 398 aa  48.5  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  25.68 
 
 		 376 aa  48.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  34.48 
 
 		 680 aa  48.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  22.31 
 
 		 430 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0515  hypothetical protein  28.4 
 
 		 283 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  22.47 
 
 		 430 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  22.33 
 
 		 674 aa  47  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  22.47 
 
 		 430 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  22.47 
 
 		 430 aa  46.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  22.46 
 
 		 377 aa  46.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  21.1 
 
 		 674 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  22.26 
 
 		 401 aa  45.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  22 
 
 		 414 aa  45.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93383  predicted protein  27.88 
 
 		 318 aa  45.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111768  normal  0.0677184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>