20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1893 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 
117 aa  235  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  40.23 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  36.14 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  33.94 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  31.4 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  38.04 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  34.04 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  32.22 
 
 
273 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  30.95 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  26.19 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  30.59 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  30.12 
 
 
222 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  27.05 
 
 
210 aa  44.3  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  24.75 
 
 
271 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  26.19 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  30.93 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  30.49 
 
 
276 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  30.95 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  30.36 
 
 
222 aa  40  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>