More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0674 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0674  ribosomal protein S2  100 
 
 		 231 aa  476  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1554  30S ribosomal protein S2  49.56 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541684  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1629  30S ribosomal protein S2  51.38 
 
 		 242 aa  244  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2641  30S ribosomal protein S2  51.38 
 
 		 242 aa  244  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2708  30S ribosomal protein S2  51.38 
 
 		 242 aa  244  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000765128  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2815  30S ribosomal protein S2  51.38 
 
 		 242 aa  244  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3281  30S ribosomal protein S2  51.38 
 
 		 242 aa  244  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000428583  hitchhiker  0.0000650106 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1139  30S ribosomal protein S2  52.29 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000783966  normal  0.110199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1348  30S ribosomal protein S2  50.92 
 
 		 242 aa  242  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164287  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2885  30S ribosomal protein S2  51.83 
 
 		 242 aa  242  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000206646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3161  30S ribosomal protein S2  50.92 
 
 		 242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00024185  normal  0.41061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1270  30S ribosomal protein S2  50.46 
 
 		 242 aa  242  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00260886  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1851  30S ribosomal protein S2  52.07 
 
 		 242 aa  242  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2902  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000838626  normal  0.171153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1450  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000541736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1445  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000563194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1481  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000136329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002746  SSU ribosomal protein S2p (SAe)  51.15 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0133087  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1088  30S ribosomal protein S2  53 
 
 		 239 aa  239  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0768857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0238  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.593758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2635  30S ribosomal protein S2  50.92 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253973  normal  0.214401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0256  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.424632  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0254  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0238  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0241  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03237  30S ribosomal protein S2  51.15 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1013  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000151526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1066  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00351639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3435  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  238  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0042148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0162  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00314588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0171  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0173  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00167  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00889913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3434  ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  238  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0180  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  238  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0179  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  238  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0347621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  237  9e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  237  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3491  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  238  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177739  normal  0.659943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00166  hypothetical protein  51.61 
 
 		 241 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00754113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3165  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  237  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  51.36 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2981  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  51.12 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3790  30S ribosomal protein S2  52.07 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  52.04 
 
 		 307 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  51.12 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0707  30S ribosomal protein S2  51.15 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0255267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  48.67 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  47.32 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  47.35 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1553  ribosomal protein S2  46.22 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0527  ribosomal protein S2  49.34 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.53334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  48.26 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2976  ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  49.09 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  46.43 
 
 		 301 aa  232  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  49.09 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  50 
 
 		 262 aa  231  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  48.64 
 
 		 281 aa  231  5e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  49.33 
 
 		 244 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2427  30S ribosomal protein S2  49.31 
 
 		 243 aa  231  9e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  45.98 
 
 		 284 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  49.09 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  48.18 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  45.98 
 
 		 284 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  47.95 
 
 		 296 aa  230  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  50.45 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  45.98 
 
 		 284 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  48.64 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17060  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  47.73 
 
 		 255 aa  229  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  46.33 
 
 		 258 aa  229  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  46.12 
 
 		 273 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  48.2 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  49.09 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  49.56 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  50.68 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  50.88 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1483  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  46.43 
 
 		 255 aa  228  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1863  30S ribosomal protein S2  48.91 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2548  30S ribosomal protein S2  48.66 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.443564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  45.98 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1859  30S ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 332 aa  227  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.113122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0808  ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15468  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  46.43 
 
 		 272 aa  227  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1103  ribosomal protein S2  48.23 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1369  30S ribosomal protein S2  48.4 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  45.54 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  44.69 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  48.4 
 
 		 316 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  47.75 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  48.18 
 
 		 314 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1960  30S ribosomal protein S2  48.86 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  47.17 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0460  30S ribosomal protein S2  48.4 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3053  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>