38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6023 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  100 
 
 		 139 aa  269  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  48.76 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  50 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2666  Vitamin K epoxide reductase  35.07 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  30.2 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  33.33 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0803  vitamin K epoxide reductase  32.81 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  35 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  30.56 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  31.85 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  38.54 
 
 		 214 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  36.17 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  35.11 
 
 		 210 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5771  Vitamin K epoxide reductase  31.54 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  38.83 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3618  Vitamin K epoxide reductase  33.63 
 
 		 339 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00203549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  30.08 
 
 		 211 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  32.84 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1588  hypothetical protein  35.14 
 
 		 288 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302546  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  32.12 
 
 		 218 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  29.36 
 
 		 214 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  32.12 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  32.12 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  32.38 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  31.91 
 
 		 220 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  27.48 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  28.18 
 
 		 258 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  32.22 
 
 		 208 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  26.92 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  35.42 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  28.45 
 
 		 205 aa  42.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3639  Vitamin K epoxide reductase  30.08 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.958294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  27.69 
 
 		 390 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  28.32 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  28.71 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1734  Vitamin K epoxide reductase  32.06 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  27.93 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  31.2 
 
 		 246 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>