72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5723 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 439 aa  910    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  55.03 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  57.75 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  55.9 
 
 		 606 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  64.11 
 
 		 628 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  63.14 
 
 		 626 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  57.32 
 
 		 632 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.69 
 
 		 378 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  30 
 
 		 1061 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.77 
 
 		 773 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.98 
 
 		 1034 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.01 
 
 		 1034 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.08 
 
 		 824 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.26 
 
 		 1074 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.07 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.34 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  27.44 
 
 		 429 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.65 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.16 
 
 		 889 aa  110  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.46 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  29.08 
 
 		 586 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  27.74 
 
 		 507 aa  86.7  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.79 
 
 		 563 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  29.95 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.55 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.44 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.17 
 
 		 557 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.21 
 
 		 557 aa  74.7  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  30.69 
 
 		 815 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.17 
 
 		 559 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.63 
 
 		 568 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  33.63 
 
 		 821 aa  69.3  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.74 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.63 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.64 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.97 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.06 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  23.91 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.54 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.77 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.29 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.03 
 
 		 361 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.23 
 
 		 375 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.23 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  30 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  30 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  23.68 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.46 
 
 		 378 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.63 
 
 		 375 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.46 
 
 		 375 aa  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.08 
 
 		 375 aa  49.7  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.17 
 
 		 383 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  30.08 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.69 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.69 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.08 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.69 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.69 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.98 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.98 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.98 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.5 
 
 		 262 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.45 
 
 		 378 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.27 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1727  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.55 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.3 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  26.03 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.03 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.93 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.72 
 
 		 375 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.1 
 
 		 380 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  25.44 
 
 		 375 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>