24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3593 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3593  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  350  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2404  hypothetical protein  49.72 
 
 		 189 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3033  hypothetical protein  42.78 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3881  hypothetical protein  45.12 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3588  hypothetical protein  45.83 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116904  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  41.04 
 
 		 193 aa  134  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3842  hypothetical protein  39.18 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  31.98 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2525  hypothetical protein  26.59 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  28.3 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  34.95 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  24.58 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  25.61 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  35.11 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  30.28 
 
 		 167 aa  44.7  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  28.06 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  27.42 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  27.92 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  31.11 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  46.94 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  26.29 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  23.19 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  27.69 
 
 		 175 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  27.73 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>