66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0963 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0963  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  67.91 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  69.52 
 
 		 260 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  69.52 
 
 		 260 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  67.91 
 
 		 259 aa  225  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  66.01 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  59.04 
 
 		 253 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  45.6 
 
 		 280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  45.6 
 
 		 280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  45.6 
 
 		 280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  45.6 
 
 		 280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  45.6 
 
 		 280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 257 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 257 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 257 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 244 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 257 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  43.01 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  48.47 
 
 		 249 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2974  transposase IS4 family protein  37.06 
 
 		 284 aa  92.8  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3531  transposase IS4 family protein  37 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2917  transposase IS4 family protein  37 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3449  transposase IS4 family protein  37 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2996  transposase IS4 family protein  34.69 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5748  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.970516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2771  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6762  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0960  hypothetical protein  36.68 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  34.34 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  34.34 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1122  transposase  34.34 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2963  transposase IS4 family protein  33.67 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0248  transposase  31.31 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1315  hypothetical protein  70 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1999  transposase IS4 family protein  38.31 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0143016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3548  transposase IS4 family protein  35.32 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0747945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2602  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1206  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0696  transposase IS4 family protein  40.94 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2123  putative IS493-like transposase  46.88 
 
 		 76 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.701384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1614  hypothetical protein  54.35 
 
 		 81 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0208  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000590832 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4509  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2986  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2882  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3998  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.936771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3330  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1566  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4523  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4007  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4258  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4706  hypothetical protein  31.01 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1845  hypothetical protein  24.14 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.072763 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1055  hypothetical protein  24.83 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.719775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0448  hypothetical protein  24.83 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4578  transposase IS4 family protein  31.65 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0992  hypothetical protein  24.83 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.160605 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0575  hypothetical protein  24.83 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1316  hypothetical protein  24.14 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3942  transposase, IS4 family protein  25.85 
 
 		 197 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0553  hypothetical protein  24.14 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000297126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3862  hypothetical protein  25.85 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3899  transposase IS702 family protein  25.85 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5798  transposase IS5 family protein  25.85 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5812  transposase IS5 family protein  25.85 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1490  hypothetical protein  24.41 
 
 		 200 aa  43.5  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>