139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0659 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0659  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  100 
 
 
388 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1592  secreted protein  40.22 
 
 
392 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121607  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13780  alpha/beta hydrolase family protein  39.39 
 
 
451 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6355  hypothetical protein  31.91 
 
 
337 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15580  alpha/beta hydrolase family protein  36.78 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1663  secreted protein  34.65 
 
 
443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1656  secreted protein  33.16 
 
 
425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000081401 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12930  hypothetical protein  33.59 
 
 
466 aa  149  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  25.74 
 
 
313 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  31.42 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  30.11 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0108  hypothetical protein  25.09 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000248564  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  26.39 
 
 
311 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2712  hypothetical protein  23.72 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00940058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  27.86 
 
 
283 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  25.82 
 
 
284 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.82 
 
 
280 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  33.91 
 
 
274 aa  62.8  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  25.41 
 
 
293 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.33 
 
 
315 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  30.77 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  25.41 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  25.41 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  25.41 
 
 
293 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  25.41 
 
 
284 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  25.41 
 
 
284 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.75 
 
 
302 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  23.48 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.68 
 
 
314 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  24.11 
 
 
294 aa  60.1  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  25 
 
 
284 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  25.34 
 
 
295 aa  59.7  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  25 
 
 
284 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
285 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  25.56 
 
 
277 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  29.73 
 
 
276 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  25.11 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  24.46 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  24.58 
 
 
265 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  30.82 
 
 
282 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  27.44 
 
 
278 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  32.45 
 
 
320 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.67 
 
 
314 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  22.32 
 
 
313 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  31.65 
 
 
266 aa  56.6  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  24.55 
 
 
306 aa  56.2  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  24.77 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  26.77 
 
 
275 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  25.74 
 
 
271 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  24.26 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  26.09 
 
 
303 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  31.01 
 
 
267 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  27.48 
 
 
294 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  21.46 
 
 
313 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  28.42 
 
 
254 aa  53.5  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  23.25 
 
 
319 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  23.25 
 
 
319 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  28.29 
 
 
345 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.87 
 
 
283 aa  53.5  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  25.75 
 
 
337 aa  52.8  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  33.59 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  25.32 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  31.09 
 
 
281 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  22.81 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
288 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
287 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  24.26 
 
 
292 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
273 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  26.46 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  28 
 
 
290 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  21.62 
 
 
267 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  29.41 
 
 
295 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1712  hypothetical protein  27.27 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81171  normal  0.0796717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0600  dipeptidyl peptidase IV  28.49 
 
 
768 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0141822  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  26.46 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  24.09 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3566  hypothetical protein  28.37 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  31.48 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  29.41 
 
 
295 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  26.16 
 
 
287 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  25.2 
 
 
292 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  24.6 
 
 
309 aa  47  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  29.11 
 
 
295 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  30.63 
 
 
301 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  29.32 
 
 
254 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  27.92 
 
 
294 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  21.31 
 
 
313 aa  46.2  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  29.73 
 
 
301 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  27.6 
 
 
282 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3674  carboxylesterase  22.63 
 
 
247 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000231487  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  29.81 
 
 
264 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24120  predicted protein  26.55 
 
 
568 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.84 
 
 
635 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  29.21 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  29.84 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  19.65 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>