18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0555 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  900    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  48.49 
 
 		 420 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  42.44 
 
 		 496 aa  300  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  38.76 
 
 		 501 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  38.26 
 
 		 501 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  34.98 
 
 		 493 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  36.2 
 
 		 502 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  35.97 
 
 		 502 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  35.97 
 
 		 502 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  35.08 
 
 		 468 aa  200  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  34.16 
 
 		 496 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  37.45 
 
 		 527 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  24.89 
 
 		 524 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  22.57 
 
 		 533 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  29.94 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  27.73 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  31.31 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  30.17 
 
 		 610 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>