More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0315 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0315  dihydropteroate synthase  100 
 
 
261 aa  501  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35630  Dihydropteroate synthase  67.55 
 
 
282 aa  301  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  61.89 
 
 
275 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  61.89 
 
 
275 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  61.51 
 
 
275 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  59.93 
 
 
270 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  62.98 
 
 
486 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5370  dihydropteroate synthase  60.82 
 
 
268 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4015  dihydropteroate synthase  62.75 
 
 
283 aa  275  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9173  Dihydropteroate synthase  62.9 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  56.98 
 
 
291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4732  dihydropteroate synthase  62.74 
 
 
291 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0090044  decreased coverage  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3445  dihydropteroate synthase  64.11 
 
 
291 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180221  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  57.14 
 
 
300 aa  268  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  57.2 
 
 
314 aa  268  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13640  dihydropteroate synthase 1 folp  59.92 
 
 
280 aa  267  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.313488  hitchhiker  0.00155849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0618  dihydropteroate synthase  61.96 
 
 
286 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8423  dihydropteroate synthase  57.81 
 
 
293 aa  255  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0850  dihydropteroate synthase  66.29 
 
 
318 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2893  dihydropteroate synthase  57.14 
 
 
302 aa  249  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0446  dihydropteroate synthase  59 
 
 
286 aa  244  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654921  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2102  dihydropteroate synthase  58.17 
 
 
285 aa  244  9e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0561  dihydropteroate synthase  60.45 
 
 
290 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32070  Dihydropteroate synthase  62.45 
 
 
351 aa  240  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4503  dihydropteroate synthase  63.71 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0540  dihydropteroate synthase  61.07 
 
 
296 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2985  dihydropteroate synthase  60.08 
 
 
315 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167684  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  58.85 
 
 
315 aa  228  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1851  dihydropteroate synthase  47.99 
 
 
291 aa  226  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12820  Dihydropteroate synthase  53.1 
 
 
285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 
287 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 
280 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0207  dihydropteroate synthase  56.6 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  43.32 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
259 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  50.76 
 
 
278 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0168  dihydropteroate synthase  53.05 
 
 
304 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00447644  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4407  dihydropteroate synthase  57.25 
 
 
311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
282 aa  212  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
279 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
279 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  49.8 
 
 
281 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0316  dihydropteroate synthase  52.53 
 
 
306 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  44.94 
 
 
436 aa  208  7e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
278 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0638  dihydropteroate synthase  49.24 
 
 
288 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 
283 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  46.51 
 
 
278 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  43.03 
 
 
278 aa  202  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  42.15 
 
 
274 aa  201  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  46.77 
 
 
294 aa  201  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  43.41 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  40.08 
 
 
376 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 
400 aa  199  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  53.09 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  41.6 
 
 
397 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  45.9 
 
 
285 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 
279 aa  198  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  38.7 
 
 
288 aa  198  7e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  46.72 
 
 
400 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  45.1 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0970  dihydropteroate synthase  39.15 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  52.67 
 
 
283 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01260  Dihydropteroate synthase  53.64 
 
 
305 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  53.28 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
286 aa  195  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  41.34 
 
 
278 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10401  putative dihydropteroate synthase  39.15 
 
 
261 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  44.92 
 
 
279 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  39.62 
 
 
281 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  41.77 
 
 
258 aa  194  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10401  putative dihydropteroate synthase  40.31 
 
 
281 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09371  putative dihydropteroate synthase  36.54 
 
 
299 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  41.6 
 
 
277 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  42.47 
 
 
277 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0153  dihydropteroate synthase  48.67 
 
 
311 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0829  dihydropteroate synthase  48.16 
 
 
259 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.310722  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  46.33 
 
 
272 aa  192  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  41.31 
 
 
277 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 
277 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
277 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  42.47 
 
 
284 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  42.62 
 
 
280 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  42.62 
 
 
280 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  42.62 
 
 
280 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  42.62 
 
 
280 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  53.5 
 
 
283 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  42.62 
 
 
277 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  41.31 
 
 
277 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  41.47 
 
 
280 aa  191  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  46.67 
 
 
298 aa  192  7e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  43.03 
 
 
277 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 
277 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  42.21 
 
 
280 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  46.51 
 
 
817 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  40.86 
 
 
282 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  47.06 
 
 
301 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  40.93 
 
 
277 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  41.76 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>