More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1827 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
267 aa  552  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
267 aa  552  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  85.77 
 
 
267 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  75.7 
 
 
253 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  73.96 
 
 
276 aa  415  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  73.71 
 
 
252 aa  408  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  72.51 
 
 
253 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  70.52 
 
 
256 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  68.24 
 
 
255 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  65.18 
 
 
255 aa  351  8e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2879  protein serine/threonine phosphatase  60.57 
 
 
255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  45.1 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  47.46 
 
 
259 aa  224  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  38.21 
 
 
264 aa  152  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  36.8 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  37.07 
 
 
302 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  36.49 
 
 
306 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  35.5 
 
 
307 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  32.51 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  34.06 
 
 
304 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  33.19 
 
 
304 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  32.75 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  33.19 
 
 
304 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  32.75 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  37.68 
 
 
236 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  34.68 
 
 
258 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  33.98 
 
 
305 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
304 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  33.77 
 
 
301 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  32.87 
 
 
567 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  36.48 
 
 
463 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.12 
 
 
299 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  34.69 
 
 
449 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.61 
 
 
239 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  33.2 
 
 
271 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  32.62 
 
 
394 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  31.56 
 
 
548 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  32.93 
 
 
386 aa  99.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.04 
 
 
438 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 
597 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  44.44 
 
 
279 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.42 
 
 
300 aa  98.6  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  30.64 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  30.42 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  31.58 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  34.04 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.04 
 
 
611 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  27.35 
 
 
241 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  34.62 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.39 
 
 
243 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  30.88 
 
 
558 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  34.17 
 
 
466 aa  95.9  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  32.11 
 
 
300 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  32.91 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  29.83 
 
 
305 aa  95.5  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  31.56 
 
 
306 aa  95.5  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  32 
 
 
313 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  31.23 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  29.51 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  33.62 
 
 
519 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  32.77 
 
 
250 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  33.49 
 
 
422 aa  93.6  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3842  protein serine/threonine phosphatase  34.02 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104123  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  31.62 
 
 
259 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  31.92 
 
 
236 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
389 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  30.8 
 
 
574 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.39 
 
 
241 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.75 
 
 
237 aa  93.2  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.39 
 
 
299 aa  92.8  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  31.49 
 
 
252 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  32.02 
 
 
243 aa  92.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0002  protein serine/threonine phosphatase  32.58 
 
 
617 aa  92  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.818409  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  33.19 
 
 
505 aa  92  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  29.91 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  30.96 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  31.75 
 
 
472 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  32.92 
 
 
463 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.42 
 
 
238 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  35.38 
 
 
416 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  30.32 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  32.33 
 
 
404 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  31.88 
 
 
571 aa  90.5  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  34.1 
 
 
242 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0318  serine/threonine phosphatase, putative  34.51 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  31.91 
 
 
242 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  34.78 
 
 
469 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  33.76 
 
 
348 aa  89.7  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  34.65 
 
 
519 aa  89.7  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  34.06 
 
 
479 aa  89.7  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  29.13 
 
 
323 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  31.51 
 
 
250 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  31.51 
 
 
250 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  30.8 
 
 
425 aa  89.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.78 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  34.56 
 
 
265 aa  89  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  31.28 
 
 
257 aa  89  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4063  protein serine/threonine phosphatase  31.96 
 
 
255 aa  89  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000181266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>